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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004116`

染色体: Chr05 坐标: 55033344-55034649 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004116`
名称	SmilChr05G004116
描述	caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55033344 - 55034649 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025176`
GeneID	`131025176`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025176`
原始查询	`LOC131025176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like
产物	caffeoyl-CoA O-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT4G34050` (CCoAOMT1) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829551] identity=85; qcov=0.82; evalue=4.31e-59; confidence=high
Rice	`Os06g0165800` (ROMT-16) - identity=80; qcov=0.82; evalue=8.39e-55; confidence=high
GO	GO:0008171 (O-methyltransferase activity); GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01596 (Methyltransf_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025176

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810796.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810796.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810796.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810796.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810796.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55033382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B138,C20,C9
`Chr5:55033394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:55033450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A1,B100,B107,B129,B131,B132,B137,B139,B15,B25,B27,B31,B42,B43,B50,B55,B56,B65,B67,B76,B9,B93,B94,B96,C22,C23,C3,C61,C68,C73,C74,C75,C77,C81
`Chr5:55033835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B133,B91,C37
`Chr5:55033852`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B42,B43
`Chr5:55033852`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810796.1

122 aa

122

Methyltransf_3

PF01596 Methyltransf_3 35-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810796.1`	Pfam	`PF01596`	Methyltransf_3	Domain	35	111	2.3e-28	99.6	O-methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954813.1
AGAGAGAGAGAGAGAGATGGCGCAAACTGCTGTGGCGACAGAAAACCAGGCCGGCAGGCATCAGGAGGTTGGGCACAAGAGCCTCTTGCAAAGTGATGACCTCTACCAGTACATTCTTGAAACCAGTGTCTATCCCAGAGAGCCAGAGCCCATGAAAGAACTCAGGGAAATAACCGCCAATCATCCATGGAATATAATGACGACATCTGCGGATGAGGGCCAATTCTTAAACATGCTTCTGAAGCTCATCAATGCCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025176
ATGGCGCAAACTGCTGTGGCGACAGAAAACCAGGCCGGCAGGCATCAGGAGGTTGGGCACAAGAGCCTCTTGCAAAGTGATGACCTCTACCAGTACATTCTTGAAACCAGTGTCTATCCCAGAGAGCCAGAGCCCATGAAAGAACTCAGGGAAATAACCGCCAATCATCCATGGAATATAATGACGACATCTGCGGATGAGGGCCAATTCTTAAACATGCTTCTGAAGCTCATCAATGCCAAGAACACCATGGAGATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810796.1
MAQTAVATENQAGRHQEVGHKSLLQSDDLYQYILETSVYPREPEPMKELREITANHPWNIMTTSADEGQFLNMLLKLINAKNTMEIGVYTGYSLLATTLTLPDDDKVIIIRYRNTIFILIIK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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