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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004122`

染色体: Chr05 坐标: 55115101-55115900 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004122`
名称	SmilChr05G004122
描述	uncharacterized SmilChr05G004122
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55115101 - 55115900 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025182`
GeneID	`131025182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025182`
原始查询	`LOC131025182`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0647400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0647400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G14060` (AT1G14060) GCK domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837966] identity=66.1; qcov=0.322; evalue=6.49e-27; confidence=low
Rice	`Os03g0647400` - identity=62.9; qcov=0.383; evalue=2.5e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07802 (GCK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057810809.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810809.1`
3	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057810809.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810809.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55115291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B58,B94,C20,C9
`Chr5:55115342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:55115543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr5:55115571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:55115576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B125
`Chr5:55115578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B71,C2,C70
`Chr5:55115674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr5:55115727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810809.1

183 aa

183

GCK

PF07802 GCK 84-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810809.1`	Pfam	`PF07802`	GCK	Domain	84	157	5.8e-33	113.8	GCK domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954826.1
ATCTCAATGTTGCAGTTCACACAATTTGACAAAACCATTTTAAATTATTCTTTTTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGGGTTTAAGGCGAGAGGTTTAAGATCGGCAGCCATGGAGCACTTCTCCTCACAAGCAAACCCTAGCTCCACCTCCACCGCTTCCAGCCGCGCGATGTCTCCTTCAAATTCACTCCAATCCGACCAATCCAAACCCGGATCCGATCCCGCAGACCGCCCCGAAGCCCTAATTCGAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025182
ATGGAGCACTTCTCCTCACAAGCAAACCCTAGCTCCACCTCCACCGCTTCCAGCCGCGCGATGTCTCCTTCAAATTCACTCCAATCCGACCAATCCAAACCCGGATCCGATCCCGCAGACCGCCCCGAAGCCCTAATTCGAGAGTCCCCTGATCCACCCAAACCAGACGAAAAATCCCCAATTTCGGAAGATTCGACCGGAGAAGGGGGCGGCGGCGGCGATGGAGAAGGAGTGGAGGAGGAGGAGGAGGGCGAGTGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810809.1
MEHFSSQANPSSTSTASSRAMSPSNSLQSDQSKPGSDPADRPEALIRESPDPPKPDEKSPISEDSTGEGGGGGDGEGVEEEEEGECGFCLFMKAGGCRETFTDWEKCVEEGEKNKEDIVEKCFQATSALRKCMEAHSDYYAPLLEAEEAAVKQLEAEKEKETEKSTDQAAEEKSDDSEKKAAT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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