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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004156`

染色体: Chr05 坐标: 55484032-55487328 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004156`
名称	SmilChr05G004156
描述	sphinganine C4-monooxygenase 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55484032 - 55487328 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025212`
GeneID	`131025212`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025212`
原始查询	`LOC131025212`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sphinganine C4-monooxygenase 1
产物	sphinganine C4-monooxygenase 1
Arabidopsis	`AT1G14290` (SBH2) sphingoid base hydroxylase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837990] identity=75.4; qcov=0.981; evalue=3.26e-156; confidence=high
Rice	`Os02g0745700` - identity=71.4; qcov=0.962; evalue=1.52e-140; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0008610 (lipid biosynthetic process); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04116 (FA_hydroxylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025212

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057810849.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057810849.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810849.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810849.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55484092`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr5:55484092`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr5:55484095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr5:55484110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr5:55484413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B132,B64,C15,C46
`Chr5:55486747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr5:55486786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C54,C64,C66
`Chr5:55486956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B132,C15,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810849.1

265 aa

132

265

FA_hydroxylase

PF04116 FA_hydroxylase 104-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810849.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	104	240	3.3e-26	93.0	Fatty acid hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954866.1
TAATATTTATATTTGTGAGAACTCAAATGTTTATATTAAGATATTTTCGAAAGTTGAATTTTAATGTGACCAGCTGAGCTAAGTCATAGAATATTATCTAATAATGGAGTCGCAATAATTAAAATTAAAATAATTTGATATAATATATAAATACAAACACATTTCATCTCTCTCGGATCAACCCAGAACTCTTCAAGTGTGTGTGATTATCACTTTTGAGGAGGGAATAATTTGACCCCAAATTGATCCGTCCAATCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025212
ATGTTAGGTATGGAGATGATGAATGGTGTAAAAGTGTCGGACGAAATGCTGGGGACATTCGCGCCGATAATCGTGTACTGGATGTATTCGGGGATTTACGTCTTGCTAGGCTCACTCGACGATTACAGGCTGCACACGCGCAAGGATGAAGATGAGAAGAATTTGGTGTCCAAGAGCGATGTGGTCAAAGGCGTGCTCCTCCAGCAGGCGGTTCAGGCCGTCGTCGCCACTCTTCTCTTCGCCGTTACTGGAAGCGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810849.1
MLGMEMMNGVKVSDEMLGTFAPIIVYWMYSGIYVLLGSLDDYRLHTRKDEDEKNLVSKSDVVKGVLLQQAVQAVVATLLFAVTGSDSDPAQAQPTSLIVLARQFLVGMMVLDTWQYFMHRYMHQNKFLYKHIHSQHHRLVVPYAFGALYNHPVEGLLLDTVGGALSFLVSGMSPRASIFFFSFATLKTVDDHCGLWLPGNLFHLLFRNNSAYHDIHHQLYGNKYNFSQPFFVMWDRILGTYMPYSLEKNSNGGFEARPSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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