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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004161`

染色体: Chr05 坐标: 55507693-55511493 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004161`
名称	SmilChr05G004161
描述	cullin-3A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55507693 - 55511493 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025216`
GeneID	`131025216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025216`
原始查询	`LOC131025216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cullin-3A-like
产物	cullin-3A-like
Arabidopsis	`AT1G26830` (CUL3) cullin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839226] identity=82.2; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0746000` (CUL3A) - identity=80.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0031461 (cullin-RING ubiquitin ligase complex); GO:0031625 (ubiquitin protein ligase binding)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00888 (Cullin); PF10557 (Cullin_Nedd8); PF26557 (Cullin_AB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025216

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810854.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057810854.1`
3	Spindle	Spindle	0.60000	`XP_057810854.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810854.1`
5	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55507963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:55508193`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B133,B26,B33,B72,B79,C77,D7
`Chr5:55508301`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B133,B26,B33,B72,B79,C77,D7
`Chr5:55508452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B1
`Chr5:55508588`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B133,B26,B33,B72,B79,C77,D7
`Chr5:55508605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:55508944`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B133,B26,B33,B72,B79,C77,D7
`Chr5:55508959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C47
`Chr5:55509031`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B133,B26,B33,B72,B79,C77,D7
`Chr5:55509073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C20
`Chr5:55509140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr5:55509163`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B133,B26,B33,B72,B79,C77,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810854.1

734 aa

367

734

Cullin

Cullin_AB

Cullin_Nedd8

PF00888 Cullin 30-476 aa PF26557 Cullin_AB 497-632 aa PF10557 Cullin_Nedd8 664-725 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810854.1`	Pfam	`PF00888`	Cullin	Repeat	30	476	3.5e-164	548.2	Cullin alpha solenoid domain
`XP_057810854.1`	Pfam	`PF26557`	Cullin_AB	Domain	497	632	3.6e-51	173.6	Cullin alpha+beta domain
`XP_057810854.1`	Pfam	`PF10557`	Cullin_Nedd8	Domain	664	725	6.1e-26	91.0	Cullin protein neddylation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954871.1
TATGTATGTAATTGCTAATAAACAATTAATTGAAAAATGGATTGCGTTGTTGCGAAAACAATCAAACGACCGAAATTCCAATCCCTTCCTTCCAAACATTTAATTTCTTCGCACCCAAACAATCCCTAACGGGAAACCCATCGCTTCTTCACAAAGGCCTCTGAAACTTCCACAAATTAAAAACAAAAAAAAAAAAATCGAAAAGAAAAATAAAATAAGAGAAGAAATTGTATATACTTCTCCTCTCTCATTCAAAATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025216
ATGAGTAGTGGACAGAAGAAGAGGAATTTTCAGATTGAGGCGTTCAAGCACAAAGTAGTGGTGGATCCGAAGTACGCAGAGAAGACTTGGAAGGTTCTAGAGCATGCAATTCATGAGATTTATAATCACAACGCTAGTGGACTGAGCTTCGAGGAGTTATACAGAAATGCTTACAATATGGTACTACATAAATATGGGGAGAAGCTTTATTCAGGACTTGTGTCAACAATGACATTCCATCTTCAGACAATGTCCAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810854.1
MSSGQKKRNFQIEAFKHKVVVDPKYAEKTWKVLEHAIHEIYNHNASGLSFEELYRNAYNMVLHKYGEKLYSGLVSTMTFHLQTMSKSIEAAHGGSFLEELNSKWSDHNKALQMIRDILMYMDRTFIPSTHKTPVHELGLNLWRDNVVHSDKIQTRLLNTLLELILRERTGEVINRGLMRNIIKMLMDLGPSVYQEDFEKPFLDVSADFYRAESQEFIECSDCGDYLKKAERRLNEEIERVSHYLDVKSEAKITNVVEKEM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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