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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004163`

染色体: Chr05 坐标: 55520524-55521904 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004163`
名称	SmilChr05G004163
描述	transcription factor TCP15-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55520524 - 55521904 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025218`
GeneID	`131025218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025218`
原始查询	`LOC131025218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP15-like
产物	transcription factor TCP15-like
Arabidopsis	`AT1G69690` (TCP15) TCP family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843305] identity=50.8; qcov=0.732; evalue=4.32e-54; confidence=high
Rice	`Os06g0226700` (OsTCP19) - identity=48.5; qcov=1.02; evalue=5.33e-63; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810858.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810858.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810858.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810858.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55520886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:55520889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr5:55520919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr5:55520969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:55520973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C17,C74
`Chr5:55521002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B37,C45,C52
`Chr5:55521003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C17,C74
`Chr5:55521025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:55521026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	146	A10,A13,A15,A16,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A6,A7,A8,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B108,B110,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B124,B126,B129,B13,B132,B135,B136,B137,B14,B140,B15,B18,B23,B28,B29,B3,B30,B32,B36,B37,B4,B44,B47,B49,B5,B50,B53,B54,B56,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B71,B73,B76,B77,B8,B81,B83,B86,B89,B9,B91,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C25,C27,C29,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C44,C46,C47,C48,C50,C53,C54,C55,C56,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C74,C77,C78,C79,C8,C83,C84,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D8
`Chr5:55521046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C17,C74
`Chr5:55521070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C36,C52
`Chr5:55521071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B62,B96,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810858.1

328 aa

164

328

TCP

PF03634 TCP 57-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810858.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	57	183	1.1e-33	117.7	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954875.1
AATGAAAAATTATTATCAATTATATATATTTTTAAAAATCATAAAGAAATTAATTCCCACTCATTGTGTTTGTTGCTTAAAGCTTGCACTCAATCCTCTTCCCTTATCTTCTTATTCTTTCATCTCTTTCCTTTTTCTCTCTCTATAATAATTCAGAAAGGAATTTGTTACAGCTAATGGAAAGAGATTTAGAGAGAGAAAGCAAGTGAAAACATATAGTGATGCATTAGACATATATATCATCATGAATGATGGTGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025218
ATGAATGATGGTGTGGATGGAAGCACAATGCAAAGACCTAATTTTCCACTGCAATTGCTGGAAAAGAGGGAAGAAGAAGCTTGTTCGAGCTCGAATCTCGCCGTCTGCGGCGGCGAGACGGCGTTGACGGCGCCGGAGGCGATCAGGAAGCCGCCCCCGAAGCGGCCTTCCACCAAGGACAGGCACACCAAGGTCGACGGCCGCGGCCGCAGGATCCGGATGCCGGCGACCTGCGCCGCCCGCGTCTTCCAGCTCACGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810858.1
MNDGVDGSTMQRPNFPLQLLEKREEEACSSSNLAVCGGETALTAPEAIRKPPPKRPSTKDRHTKVDGRGRRIRMPATCAARVFQLTRELGHKSDGETIEWLLQQAEPAVVAATGTGTIPANFASLNISVRSSGSSLSAPSHFRSLGYFSQGFAAAAPPQLNFGESNPLLGFSNSSAAMHRAKQELRESEAAAERRRAEGDLAGNYMLQSSSGSIPASQGQIPATSFLTVNASSSHSTNGESLWQFPSMGNSGVHRGRFAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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