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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004167`

染色体: Chr05 坐标: 55571328-55572346 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004167`
名称	SmilChr05G004167
描述	uncharacterized SmilChr05G004167
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55571328 - 55572346 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025222`
GeneID	`131025222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025222`
原始查询	`LOC131025222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCHC domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839582]; symbol=AT1G26920; hit=AT1G26920; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc finger CCHC domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839582]; symbol=AT1G26920; hit=AT1G26920; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G26920` (AT1G26920) zinc finger CCHC domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839582] identity=41.6; qcov=1.11; evalue=6.87e-29; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810862.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810862.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810862.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810862.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810862.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55571604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B1,B101,C4
`Chr5:55571814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr5:55571821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B4,B7,C76
`Chr5:55571823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B19,B38,B39
`Chr5:55571829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:55571845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B93
`Chr5:55572030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B114,B4,B7,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954879.1
GCCGACTAAAAAAAGATAGCCACTACAAAACCACTCCAATTTTTTCCATTTGCATTAATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACCAAAAAGCTGAGAGAAGAGCTAATTAATTATTCATATCTACACATTTACACACTTCACTCATTTGACCGCGACTCCATTTGTCTATATAAACCTTTCAAACCCCCTTCTCTCTCCTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTCTCTCCGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025222
ATGGCGGAAACCCCAACCAAACGCCTCCGACAAGAGACCCCCGGCCTCGAAGATTCATCGAATTCGAAGCGCCACAAACCCTACACCACCATTCTCTCTCTCCTCGACGACGACGAAGAAACCCTAGAACAAAATCAGGACCTCTCCGCCATATTCACCACCCTAGAGCAAGAGCTCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCAGAATTCGATTCCCCGCCGCCGCAGCCGGAGGCTGCCGAGGAAGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810862.1
MAETPTKRLRQETPGLEDSSNSKRHKPYTTILSLLDDDEETLEQNQDLSAIFTTLEQELSSSAAAAAAAAAEFDSPPPQPEAAEEDDGGAKSVMRHLLEASDDELGIPNYSSEENLNNDTINIGLIKSDENISFNFFDNGLWEFDDVAANYYAILQSELFM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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