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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002420`

染色体: Chr01 坐标: 41661282-41666071 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002420`
名称	SmilChr01G002420
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 6.3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	41661282 - 41666071 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025223`
GeneID	`131025223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025223`
原始查询	`LOC131025223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 6.3-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 6.3-like
Arabidopsis	`AT1G12110` (NRT1.1) nitrate transporter 1.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837763] identity=66; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0155400` (OsNRT1.1A) - identity=68.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006857 (oligopeptide transport); GO:0010167 (response to nitrate); GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810866.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810866.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810866.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810866.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810866.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:41661437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:41661460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B113,B25
`Chr1:41661677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D5
`Chr1:41662740`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A15,B19,B77,C2,C34,C63,D8,D9
`Chr1:41662741`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A15,B19,B77,C2,C34,C63,D8,D9
`Chr1:41662743`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A15,B19,B77,C2,C34,C63,D8,D9
`Chr1:41662750`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B19,B77,C2,C34,D8,D9
`Chr1:41662765`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A15,B96,C62,C63
`Chr1:41662765`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A15,B96,C62,C63
`Chr1:41662766`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	89	A14,A2,A22,A23,A3,A5,A6,A7,B102,B103,B108,B109,B11,B114,B118,B119,B124,B128,B129,B130,B132,B139,B15,B16,B18,B19,B2,B26,B28,B38,B43,B45,B54,B59,B6,B62,B65,B77,B79,B8,B88,B90,B91,B95,B96,B98,C1,C14,C15,C17,C19,C2,C21,C23,C24,C3,C32,C33,C34,C36,C37,C45,C46,C47,C5,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C62,C70,C72,C77,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr1:41662774`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	86	A14,A2,A22,A3,A5,A6,A7,B102,B103,B108,B109,B11,B114,B118,B124,B128,B129,B130,B132,B15,B16,B18,B19,B2,B26,B28,B38,B43,B45,B54,B59,B6,B62,B65,B66,B77,B79,B8,B88,B90,B91,B95,B96,C1,C14,C15,C17,C19,C2,C21,C23,C24,C3,C32,C33,C34,C36,C37,C45,C46,C47,C5,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C62,C70,C72,C77,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C87,C9,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr1:41662776`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A15,B96,C62,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810866.1

596 aa

298

596

PTR2

PF00854 PTR2 102-539 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810866.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	102	539	2.5e-113	379.6	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954883.1
TGAATCAATCATACCCACAAGAAGTATTTATAATAAAGTAATCTGATCCGTCCAAAGGGGCACACCACAGCTATATAAAGAAACTCTGCCTCTGCCTCACCTCACTACTTATACTCACGGGCTCCAAACCCACATCCAAACAAATGGCTTCTTCACTCCCCCAAACAAAACCAGACGCCGAGACGCTCCCCGATGCCTGGGACTACAAGGGCCGCCCCGCCCTCAGATCCTCCTCCGGCGGCTGGGCCACCGCCGCCATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025223
ATGGCTTCTTCACTCCCCCAAACAAAACCAGACGCCGAGACGCTCCCCGATGCCTGGGACTACAAGGGCCGCCCCGCCCTCAGATCCTCCTCCGGCGGCTGGGCCACCGCCGCCATGATTCTAGGTGTGGAGGGGTGTGAGAGGCTGACGACGCTGGGAATCGCGGTCAATCTGCTCACCTACTTGACTCGCACCATGCATTTGGGAAATGCTGTTTCCGCCAACACTGTCACCAATTTTCTTGGCACCTCTTTCATGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810866.1
MASSLPQTKPDAETLPDAWDYKGRPALRSSSGGWATAAMILGVEGCERLTTLGIAVNLLTYLTRTMHLGNAVSANTVTNFLGTSFMLCLLGGFIADTYLGRYLTIGIFATVQATGVTILTISTIIPSLRPPKCAAGSPSCIPASSKQMLVLYAALYLTALGTGGLKSSVSGFGSDQFDESDAKEKKQMIKFFNWFFFFISIGALAAVTVLVYIQDHLGREWGYGICACAILVGLLVFLSGTKRYRFKKLVGSPLTQIASV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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