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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004171`

染色体: Chr05 坐标: 55647246-55650657 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004171`
名称	SmilChr05G004171
描述	binding partner of ACD11 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55647246 - 55650657 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025226`
GeneID	`131025226`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025226`
原始查询	`LOC131025226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	binding partner of ACD11 1-like
产物	binding partner of ACD11 1-like
Arabidopsis	`AT1G14340` (AT1G14340) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837995] identity=48.5; qcov=1.12; evalue=1.31e-66; confidence=high
Rice	`Os04g0641400` - identity=41.5; qcov=1.12; evalue=8.62e-51; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025226

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810867.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810867.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057810874.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810867.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55648426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C12,C5
`Chr5:55648435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B91
`Chr5:55649742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B6,C50,C67
`Chr5:55649986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B18,C25,D2
`Chr5:55650016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B133,B18,C25
`Chr5:55650166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B136,B63,B95,C25
`Chr5:55650364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:55650378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810867.1

249 aa

124

249

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-76 aa

XP_057810868.1

249 aa

124

249

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-76 aa

XP_057810869.1

249 aa

124

249

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-76 aa

XP_057810870.1

249 aa

124

249

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-76 aa

XP_057810871.1

249 aa

124

249

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-76 aa

XP_057810872.1

249 aa

124

249

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-76 aa

XP_057810873.1

249 aa

124

249

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-76 aa

XP_057810874.1

211 aa

106

211

RRM_1

PF00076 RRM_1 14-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810867.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	76	8.3e-11	42.3	RNA recognition motif
`XP_057810868.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	76	8.3e-11	42.3	RNA recognition motif
`XP_057810869.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	76	8.3e-11	42.3	RNA recognition motif
`XP_057810870.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	76	8.3e-11	42.3	RNA recognition motif
`XP_057810871.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	76	8.3e-11	42.3	RNA recognition motif
`XP_057810872.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	76	8.3e-11	42.3	RNA recognition motif
`XP_057810873.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	76	8.3e-11	42.3	RNA recognition motif
`XP_057810874.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	14	65	6.1e-10	39.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

8 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954884.1
AACTGCTCTGTATAAATTATTGCGAAATTAAAAACTCAAAACTTTAACGGTGTTCATCAACACGAAGCTTCATCCTCAAATCTCACCCAATTTCTATCTTTGGTTTCACATTTTTAGCTAAATTAGTTTGCTTGTTTGAAGATCAATGAGGCCAGAAATGAAGACGAGAGGTTATGCAGTAGAAATTACAAACCTATCTCCTAATGCAACTGAGAAAGATGTTCGTGATTTTCTCGCCTTCTGTGGTTCAATTCAACATG...

XM_057954891.1
AACTGCTCTGTATAAATTATTGCGAAATTAAAAACTCAAAACTTTAACGGTGTTCATCAACACGAAGCTTCATCCTCAAATCTCACCCAATTTCTATCTTTGGTTTCACATTTTTAGCTAAATTAGTTTGCTTGTTTGAAGATCAATGAGGCCAGAAATGAAGACGAGAGGTTATGCAGTAGAAATTACAAACCTATCTCCTAATGCAACTGAGAAAGATGTTCGTGATTTTCTCGCCTTCTGTGGTTCAATTCAACATG...

CDS

8 records

下载 CDS FASTA

LOC131025226
ATGAGGCCAGAAATGAAGACGAGAGGTTATGCAGTAGAAATTACAAACCTATCTCCTAATGCAACTGAGAAAGATGTTCGTGATTTTCTCGCCTTCTGTGGTTCAATTCAACATGTTGAACTCGTCAGAGCCGGTGACTCTGCATGTATAGCCTATGTGACTTTCAAAAATCCGCATGCTGCGGAAACTGCTGTCCTTCTCAGTGGAGACACCGTATTGGATCAACCTGTACGCATAACACAATGGGGACACTGCGATGA...

Protein

8 records

下载 Protein FASTA

XP_057810867.1
MRPEMKTRGYAVEITNLSPNATEKDVRDFLAFCGSIQHVELVRAGDSACIAYVTFKNPHAAETAVLLSGDTVLDQPVRITQWGHCDDEYNVHNSSSWKIEDDSNLSPERHKAAPSAGKAVSFAQDTVKAVAAKGFVLGKDAVVRAKAYGQSHQVPAAAIAKASQLSQGIGLTDKVTAGIEAAKSVDQRYHISGTTRSAAYVTQRAAASAANAVVSSSYFSKGALWLSGALDRASQVAADLGNRGAGKDS

XP_057810868.1
MRPEMKTRGYAVEITNLSPNATEKDVRDFLAFCGSIQHVELVRAGDSACIAYVTFKNPHAAETAVLLSGDTVLDQPVRITQWGHCDDEYNVHNSSSWKIEDDSNLSPERHKAAPSAGKAVSFAQDTVKAVAAKGFVLGKDAVVRAKAYGQSHQVPAAAIAKASQLSQGIGLTDKVTAGIEAAKSVDQRYHISGTTRSAAYVTQRAAASAANAVVSSSYFSKGALWLSGALDRASQVAADLGNRGAGKDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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