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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004179`

染色体: Chr05 坐标: 55703277-55705843 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004179`
名称	SmilChr05G004179
描述	mitochondrial outer membrane protein porin of 36 kDa-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55703277 - 55705843 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025237`
GeneID	`131025237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025237`
原始查询	`LOC131025237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial outer membrane protein porin of 36 kDa-like
产物	mitochondrial outer membrane protein porin of 36 kDa-like
Arabidopsis	`AT3G01280` (VDAC1) voltage dependent anion channel 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820914] identity=64.4; qcov=0.989; evalue=1.01e-129; confidence=high
Rice	`Os09g0361400` (OSVDAC1) - identity=63.7; qcov=0.982; evalue=3.55e-128; confidence=high
GO	GO:0005741 (mitochondrial outer membrane); GO:0008308 (voltage-gated monoatomic anion channel activity); GO:0098656 (monoatomic anion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01459 (Porin_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057810887.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057810887.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	1.00000	`XP_057810887.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810887.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55703603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:55703642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:55704465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D11
`Chr5:55704943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:55704955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B98,C60
`Chr5:55704978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:55705003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B48
`Chr5:55705012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B133
`Chr5:55705015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B131,C16,C28,C79
`Chr5:55705086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:55705387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B27,C61
`Chr5:55705531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810887.1

278 aa

139

278

Porin_3

PF01459 Porin_3 6-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810887.1`	Pfam	`PF01459`	Porin_3	Family	6	271	1.8e-77	261.1	Eukaryotic porin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954904.1
TTTAACAATCTGCATGTTTTGACGCAACAAATTAGGATCAGAAAATTCATAGCTAAGTACACATACTCTCTCGTTCTCTCTCTCAAAAATACTCATTTCTCTCTCTGCAATTTCTCTGCAAAACTCAAGAAGAAGAAAATGGTTTACGTCAAGGGTCCAGGCCTCTACTCAGACATTGGCAAGAGAGCTAGAGATCTTCTTTACAAGGATTATCAGGGCGATCGGAAGTTCACTCTCAGTACTTTGACTTCAACTGGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025237
ATGGTTTACGTCAAGGGTCCAGGCCTCTACTCAGACATTGGCAAGAGAGCTAGAGATCTTCTTTACAAGGATTATCAGGGCGATCGGAAGTTCACTCTCAGTACTTTGACTTCAACTGGGGTGGCCATTACTTCATCAGGGACTAAGAAAGGGGACTTGTTCTTAGCTGATGTTAGCACCCTTTTAAAGAACAAGAACATCACCACTGATGTGAAAGTGGATACCAGCTCCAATGTATTCACAACCATCACTATCGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810887.1
MVYVKGPGLYSDIGKRARDLLYKDYQGDRKFTLSTLTSTGVAITSSGTKKGDLFLADVSTLLKNKNITTDVKVDTSSNVFTTITIDEPAPGVKAIFRFVAPDQKSGKVELQYLHEYAGISTSLGFTAKPTVNFSGVAGNHRATVGTDISFDTGTGNFTKLNAGISLASTDLIASLMVNDKGQSVTASYFHTVSPLTVTTVGAEFTHSFSSNENTLTFGAHHLMDPTTAVKARVNNYGKASALLQHEWRPKSLITISGEVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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