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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004191`

染色体: Chr05 坐标: 55800095-55801136 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004191`
名称	SmilChr05G004191
描述	thioredoxin H2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55800095 - 55801136 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025247`
GeneID	`131025247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025247`
原始查询	`LOC131025247`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin H2-like
产物	thioredoxin H2-like
Arabidopsis	`AT5G39950` (TRX2) thioredoxin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833992] identity=49.2; qcov=1; evalue=2.48e-47; confidence=medium
Rice	`Os03g0800700` (OsTRXh4) - identity=50.4; qcov=0.977; evalue=8.3e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2); PF14595 (Thioredoxin_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057810898.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.40000	`XP_057810898.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057810898.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057810898.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55800462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr5:55800522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:55800643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr5:55800845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810898.1

132 aa

132

Thioredoxin_9

Thioredoxin_2

Thioredoxin

PF14595 Thioredoxin_9 42-110 aa PF13098 Thioredoxin_2 44-121 aa PF00085 Thioredoxin 45-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810898.1`	Pfam	`PF14595`	Thioredoxin_9	Family	42	110	1.4e-05	25.7	Thioredoxin
`XP_057810898.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	44	121	3.1e-08	34.6	Thioredoxin-like domain
`XP_057810898.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	45	128	3.4e-26	91.9	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954915.1
ATAAAGAGTGCAATGGTTTATAGGCCTCTTGTTTTCTGAAAAAAATAGTTTACAAGGAAAACCATATAATATTTCCTTAAGATTAATAGAAGCCATCAACATAAAAAAAGGGTCTATTCAAGAACATATTCTTCATGGGAAGAGTGGATCATCAACCACTATAAAAGAGAGCATTGCTACAAAGCCTCAATCCAAACCAAAATATACATTCAACAATAATAGAAAGGAAAAAAGGAAAAAAAAAAGAAGGTTAAGTTAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025247
ATGGGAGCTGGTGTTTCCACTGGTTATGAGACTTCACCTGCAAGAACTTACGGAACAACGACGAGGAGAGGCCAGGTGGTCGCGTTTCACTCGTCGAAAACCTGGAAAATCCACTTTGAAGCCTCAAAGCTGACCCCAAAACTGCTCGTCATCGACTTCACAGCAGCGTGGTGCGGGCCCTGCCAGTATATTCAACCTGCAGTGAATGAATTTGCAGAGATATACACAGATGTGGACTTCATCAAGATTGATGTTGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810898.1
MGAGVSTGYETSPARTYGTTTRRGQVVAFHSSKTWKIHFEASKLTPKLLVIDFTAAWCGPCQYIQPAVNEFAEIYTDVDFIKIDVDELDDVAQEFGVQTMPTFILMKRGREVDKVVGAKKDDLRRKIDKHRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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