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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004226`

染色体: Chr05 坐标: 56099672-56101829 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004226`
名称	SmilChr05G004226
描述	uncharacterized SmilChr05G004226
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56099672 - 56101829 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025273`
GeneID	`131025273`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025273`
原始查询	`LOC131025273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0741900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0741900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G24050` (AT1G24050) RNA-processing, Lsm domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839017] identity=53.2; qcov=0.945; evalue=5.58e-62; confidence=high
Rice	`Os02g0741900` - identity=63.7; qcov=0.989; evalue=2.78e-85; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09793 (AD); PF21166 (LSM12_LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810954.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810954.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057810954.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810954.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56101103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,A18
`Chr5:56101142`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B43,B96,C48,C50,C60
`Chr5:56101142`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B43,B96,C48,C50,C60
`Chr5:56101146`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B96,C50,C60
`Chr5:56101701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810954.1

181 aa

181

LSM12_LSM

PF21166 LSM12_LSM 9-65 aa PF09793 AD 84-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810954.1`	Pfam	`PF21166`	LSM12_LSM	Domain	9	65	2.7e-22	78.8	LSM12, LSM domain
`XP_057810954.1`	Pfam	`PF09793`	AD	Domain	84	166	1.1e-25	90.1	Anticodon-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954971.1
AGAATTAAAGATTCTCTCTCTCTCTCTGCGCAATACAAAGAAGAGAAAAAATCAATCGCGAAAAACATTGCAAAATTTCAGTGGTGCAGCAATGGAAGCTCAAGGTCAAGGCGACGAATTTGCAATTGGCTGCATACTATCAATCAAAACGACTCTCGGCGAAGAATTCCAAGCACAAGTCATCTCTTTTGACCGCCCTTCCAACCTCCTCATCCTTCAAGAGGAATCGAAATCTGGGGCAGGGCCGAAGAGGAATATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025273
ATGGAAGCTCAAGGTCAAGGCGACGAATTTGCAATTGGCTGCATACTATCAATCAAAACGACTCTCGGCGAAGAATTCCAAGCACAAGTCATCTCTTTTGACCGCCCTTCCAACCTCCTCATCCTTCAAGAGGAATCGAAATCTGGGGCAGGGCCGAAGAGGAATATTAGGTTGCTGAAGGCTAATTACATTAAAGAATTCAATTTTTTAGGTCAAGGCGACGACCCACTTGATGTGAAGAAGTGTTTTCTCGATCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810954.1
MEAQGQGDEFAIGCILSIKTTLGEEFQAQVISFDRPSNLLILQEESKSGAGPKRNIRLLKANYIKEFNFLGQGDDPLDVKKCFLDLNTLQSKEESAIRQAEAEAERIGVGVTAQAQSLFDALSKTLPVRWDKSTIVVMNEVRVSSPYLPESVTGGTAAANERVRKVVEFEKKRLQSRYGSQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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