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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004229`

染色体: Chr05 坐标: 56109319-56115211 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004229`
名称	SmilChr05G004229
描述	WAT1-related protein At1g70260-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56109319 - 56115211 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025275`
GeneID	`131025275`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025275`
原始查询	`LOC131025275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WAT1-related protein At1g70260-like
产物	WAT1-related protein At1g70260-like
Arabidopsis	`AT1G70260` (UMAMIT36) nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843362] identity=47.3; qcov=1; evalue=1.56e-119; confidence=high
Rice	`Os08g0561500` (OsUMAMIT12) - identity=31.7; qcov=0.941; evalue=2.74e-52; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00892 (EamA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025275

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057810957.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057810957.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057810957.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810957.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56109721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:56109758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:56110195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:56110196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:56111379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C63
`Chr5:56111380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,D1
`Chr5:56111399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B42,B43
`Chr5:56111456`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A22,B11,B110,B136,B138,B27,B68,B87,C21,C29,C3,C43,C45,C70,C78
`Chr5:56111458`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A22,B11,B110,B136,B138,B27,B68,B87,C21,C29,C3,C43,C45,C70,C78
`Chr5:56111474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B77
`Chr5:56114350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B20,D10
`Chr5:56114628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B14,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810957.1

372 aa

186

372

EamA

PF00892 EamA 19-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810957.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	19	159	1.9e-10	41.9	EamA-like transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954974.1
GCTTCACACTTTCATGAAAGGTTATGCTTCATTTTTCTTCTCTCTCTCCCTTTCTCTCTCATCCTATTTTGAAATCACCGATATTTCAACAATAAATATACAGCAATTGAGATTGAGAGGGAAGAAATTAAAACTGAAACACGACACAAGTGGAAATATCTAGAGAGAGAGAAGAGAGAGATGGGCGGCAGCGGCAGCACGAAGGCGGCGATGGTGGAGGCGGCGCCCTGCGCCGCCATGGTGTTGGTGGAGGGCTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025275
ATGGGCGGCAGCGGCAGCACGAAGGCGGCGATGGTGGAGGCGGCGCCCTGCGCCGCCATGGTGTTGGTGGAGGGCTCCATTATAGCATTGACTATAATGGCTAGCACCGCCATGGCTCGAGGAATGAGCCCTTTTGTGTTTGTGGTCTACACCAATATTCTTGGATCAATTATTCTACTCCCTTATTGCTTCTTCTATGAGAGAGAGAGGTCGGAGGAGGCGATCTTGACCTTCAAGTTTCTGGTGCGAGTGTTCTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810957.1
MGGSGSTKAAMVEAAPCAAMVLVEGSIIALTIMASTAMARGMSPFVFVVYTNILGSIILLPYCFFYERERSEEAILTFKFLVRVFLLGFIGITIAQNLAYVGLSYSSPIVACGMANQIPAFSFILGIILRTIKFNWKSSGSQARVLGTLISFAGAILVTLYRGPTIKNHSFPSLSFSASAVAPPRLFVFLAPHENWVLGCILFAASSFTLAIWNIVQVGTVKMCPNIMKIISFYSLFGTMQSAAVALFLERNPSAWRLDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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