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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004232`

染色体: Chr05 坐标: 56141139-56142974 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004232`
名称	SmilChr05G004232
描述	RING-H2 finger protein ATL47-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56141139 - 56142974 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025278`
GeneID	`131025278`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025278`
原始查询	`LOC131025278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL47-like
产物	RING-H2 finger protein ATL47-like
Arabidopsis	`AT5G40250` (AT5G40250) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834023] identity=53; qcov=1.04; evalue=1.31e-108; confidence=high
Rice	`Os02g0743100` - identity=47.2; qcov=1.08; evalue=1.76e-86; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025278

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057810960.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810960.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057810960.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810960.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56141638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:56141744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:56141745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B90,B92,C27,D4
`Chr5:56141749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C60,C71
`Chr5:56141765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B90,C27,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810960.1

332 aa

166

332

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-C3HC4

zf-rbx1

PF17123 zf-RING_11 99-128 aa PF13639 zf-RING_2 99-142 aa PF00097 zf-C3HC4 100-141 aa PF12678 zf-rbx1 104-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810960.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	99	128	3.3e-09	37.0	RING-like zinc finger
`XP_057810960.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	99	142	6.8e-14	52.6	Ring finger domain
`XP_057810960.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	100	141	1.4e-05	25.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057810960.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	104	142	9.2e-09	36.1	RING-H2 zinc finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954977.1
AAGTAGTACTTTAATTATCTTTAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAATATTCTTTTATCTTAAAATTTAGTGTGTCTATGAAATAGCGTCGACAAAGCTAGAGCTCATGGTTTTGAGTGTAAAAATTCTTCTTTCCCAATTTGGGCCTCTGCTTTTCTTCACCAGTTTTAAAACAAAATCCCAATTTCCAATTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTCCATGATTAACTCAGACAAGCTCTCTCATGAAGCAGCAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025278
ATGTCTTGGATTCAATCAGCTTTCGGGAGCAGAATCAGCCCCGTAATCCTCTTCATAATCGTAGTTTTGGCCGTGATTTTCTTCATCGCCGCCCTCCTCCACCTCCTCATCCGCTTCCTCGTGAAGCGGAGATCCGCGCAGGCCCGCAGCCGGCCCGAAATGCCGGGCTCGGGCGCGTTCCAGAGGCAGCTGCAGCAGCTCTTCCACCTCCACGATTCGGGCTTGGACCAGTCCCAAATCGACGCGCTCCCGGTCTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810960.1
MSWIQSAFGSRISPVILFIIVVLAVIFFIAALLHLLIRFLVKRRSAQARSRPEMPGSGAFQRQLQQLFHLHDSGLDQSQIDALPVFLYKEIMGLKEPFDCAVCLCEFSELDKLRLLPLCSHAFHIDCIDTWLLSNSTCPLCRGVILSPGFSFENPVFVFDDSKEVEDVKCGEDENSSVVSGRRVFSVRLGKLRCSNGVVVGEKENHEVGETSCSNLDGRRCYSMGSFQYVVADSELQVAFCPSGRGGERGRQHGIVDGNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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