当前解析结果
SmilChr05G004265| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004265 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004265 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G004265 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 56439176 - 56443407 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025317 |
|---|---|
| GeneID | 131025317 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025317 |
| 原始查询 | LOC131025317 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025317 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811028.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057811029.1 |
| 3 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057811029.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811028.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811028.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:56439378 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B102,B125 |
Chr5:56439410 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 18 | A5,A8,B102,B127,B2,B26,B37,B51,B68,B85,B94,C12,C27,C29,C35,C43,C63,C9 |
Chr5:56442946 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B125,B23,C10,C73 |
Chr5:56442953 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B134,B4,C28,C33,C59 |
Chr5:56442988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,C51 |
Chr5:56442998 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | A1,C59 |
Chr5:56442998 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,C59 |
Chr5:56443083 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B41,B6,B78,B85 |
Chr5:56443139 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B40,B49 |
Chr5:56443208 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B134,B4,C28,C33,C59 |
Chr5:56443210 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr5:56443251 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A22,B91 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。