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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004272`

染色体: Chr05 坐标: 56525632-56528191 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004272`
名称	SmilChr05G004272
描述	protein POOR HOMOLOGOUS SYNAPSIS 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56525632 - 56528191 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025321`
GeneID	`131025321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025321`
原始查询	`LOC131025321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein POOR HOMOLOGOUS SYNAPSIS 1
产物	protein POOR HOMOLOGOUS SYNAPSIS 1
Arabidopsis	`AT1G10710` (PHS1) poor homologous synapsis 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837614] identity=32.8; qcov=0.991; evalue=5.14e-41; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25349 (PH_PHS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811033.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057811033.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811033.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811033.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811033.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56526012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:56527375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:56527833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr5:56527887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C5,D5
`Chr5:56528086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811033.1

332 aa

166

332

PH_PHS1

PF25349 PH_PHS1 34-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811033.1`	Pfam	`PF25349`	PH_PHS1	Domain	34	172	6e-53	179.1	Poor homologous synapsis protein PH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955050.1
AAACGTATAATAAAATTTTTTAACTTCCGTTTCTTCATTCCCTCACAAGAATCAAAATGCAGAAACGTAAAACTAGCAGCTCCAAAAAATCGAAAATGGCGGGATCAGCGTTGGCCATAACCACCACCAACAAGGAGAGTGAAAACCACGCATGCGACGAGTGGCAAGTCGAATACGCGCGTTTCGTCAACTGCAGCTCGTCCGCTTTTGAGAGCACTCATCCTTCTCTGACGCCGGTTCCGAAGAGTCGCCTCCGCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025321
ATGCAGAAACGTAAAACTAGCAGCTCCAAAAAATCGAAAATGGCGGGATCAGCGTTGGCCATAACCACCACCAACAAGGAGAGTGAAAACCACGCATGCGACGAGTGGCAAGTCGAATACGCGCGTTTCGTCAACTGCAGCTCGTCCGCTTTTGAGAGCACTCATCCTTCTCTGACGCCGGTTCCGAAGAGTCGCCTCCGCGGCGTCTGGATTTCATCGTCCACCGCCGCCTCCGTCAAGCTCATCTACGAGAGAACCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811033.1
MQKRKTSSSKKSKMAGSALAITTTNKESENHACDEWQVEYARFVNCSSSAFESTHPSLTPVPKSRLRGVWISSSTAASVKLIYERTSSGTDDAVLVLSLRSKTLEVHYISKMHFSWPQISCMSGFPARGSRAVFLSYKDVDGQMQKFALRFSAIHETEKFMNFVKEILENGSPLLQCPELKSEMSSQAEAISSHVTISKSCGELQYTQPVDEAAKTELIFPPSHSTQLMLPSCAFEATQDSKPLEAAKTEAVYPPSFTQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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