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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004288`

染色体: Chr05 坐标: 56662320-56668544 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004288`
名称	SmilChr05G004288
描述	uncharacterized SmilChr05G004288
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56662320 - 56668544 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025341`
GeneID	`131025341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025341`
原始查询	`LOC131025341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837857]; symbol=AT1G12990; hit=AT1G12990; species=arabidopsis; confidence=high
产物	beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837857]; symbol=AT1G12990; hit=AT1G12990; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G12990` (AT1G12990) beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837857] identity=77.9; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0477500` (OsSTA124) - identity=70.9; qcov=0.945; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003830 (beta-1,4-mannosylglycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase activity); GO:0006044 (N-acetylglucosamine metabolic process); GO:0006487 (protein N-linked glycosylation); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04724 (Glyco_transf_17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057811053.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057811053.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811053.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811053.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811053.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56663797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B108,C39,C74,D7
`Chr5:56664583`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A3,A6,B10,C2
`Chr5:56664583`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A3,A6,B10,C2
`Chr5:56664628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C39,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811053.1

403 aa

202

403

Glyco_transf_17

PF04724 Glyco_transf_17 54-399 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811053.1`	Pfam	`PF04724`	Glyco_transf_17	Family	54	399	3.2e-183	609.3	Glycosyltransferase family 17

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102150.1
AGACAAAGGAAAACGGCTTTCATTGTAATCTTGACAACTGCCACACATTCACCAGGGCTAATATAAAACACACACAACACACACTCATATATCCCTCTGTCTTTTTCCAATTTTATTCCCTTGTCTTTAAAATTAAATTTCTTTTGGGGAAATTCGGAAAGTGGCTTTATTTATTTATTTTGTTATTTGATATATAAAAATAATTCGAGGGGTCTGGAAATTACGTTAGGGTCATATTGTTGCATTCCCTTTCTGCGGCC...

XM_057955070.1
AAAACGGCTTTCATTGTAATCTTGACAACTGCCACACATTCACCAGGGCTAATATAAAACACACACAACACACACTCATATATCCCTCTGTCTTTTTCCAATTTTATTCCCTTGTCTTTAAAATTAAATTTCTTTTGGGGAAATTCGGAAAGTGGCTTTATTTATTTATTTTGTTATTTGATATATAAAAATAATTCGAGGGGTCTGGAAATTACGTTAGGGTCATATTGTTGCATTCCCTTTCTGCGGCCGGGGGCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025341
ATGAGCGGTGTATCAAGAATTTGGGAGAAGGTGAATATGATGGCGGAAGGAGGATCTCGGAATTGTTCCAAGAAATCTGATGATATATGTGGCGATGCCTGTGGTGAGGATTCGGGAAGGGCTTTGAGCATGGCCAGATTGAGATGTATTCTGCGGGGGCTGGATTTCAAAGCATTGCTCTTTCTCTTTGTGTTGATCCCGACGTGTGTCTTTGTTATATATGTCCACGGCCAAAAGATCACGTACTTTCTGAGACCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811053.1
MSGVSRIWEKVNMMAEGGSRNCSKKSDDICGDACGEDSGRALSMARLRCILRGLDFKALLFLFVLIPTCVFVIYVHGQKITYFLRPLWESPPKPFHERPHYYHENVSMENLCKLHGWGIREYPRRVYDAVLFSNEVDILKMRWKELYPYVTEFVLLESNSTFTGLPKPNLFSTVRDQFKFVEPRLTYGQVPGRFKTGENPFVEEAYQRYTLDYLLKQAGIQDDDLLIMSDVDEIPSRHTINLLRWCDDIPPILHLRLKNY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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