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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004294`

染色体: Chr05 坐标: 56680717-56682883 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004294`
名称	SmilChr05G004294
描述	GDSL esterase/lipase At3g26430-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56680717 - 56682883 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025343`
GeneID	`131025343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025343`
原始查询	`LOC131025343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At3g26430-like
产物	GDSL esterase/lipase At3g26430-like
Arabidopsis	`AT3G26430` (AT3G26430) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822247] identity=63; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0586200` (OsGELP92) - identity=59.4; qcov=0.913; evalue=5.44e-158; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057811056.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057811056.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811056.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811056.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56680807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B16,B41,B65
`Chr5:56680813`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	135	A1,A13,A16,A21,A22,A24,A5,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B22,B25,B27,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B41,B44,B45,B48,B5,B50,B56,B57,B59,B6,B62,B64,B65,B67,B69,B7,B72,B74,B75,B76,B78,B8,B84,B85,B87,B9,B93,B94,B96,B98,B99,C10,C12,C13,C19,C20,C23,C25,C28,C31,C32,C34,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C52,C54,C56,C63,C67,C68,C7,C71,C73,C75,C77,C79,C81,C82,C83,C84,C85,C86,D11,D2,D6,D8,D9
`Chr5:56680891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:56680994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B42,B43
`Chr5:56681053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:56681065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B36,B45,C17,D5
`Chr5:56681234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr5:56681237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:56681242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B16,B48,D4
`Chr5:56681242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B48,D4
`Chr5:56681246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr5:56681255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811056.1

389 aa

194

389

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 36-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811056.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	36	364	8.5e-44	150.9	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955073.1
TATTATCACCATAAAAATAAAAATAAAAATTTCAGCTTGTCACATGCACAAAATTATTTTATTTCTTGCACTATGCAGCAACAACAACCACATTTCTGTTTCTACTTTTTTGAAAAAAAAAGATACCAAAATCTAAAAAGATAGCTGCATTTGCTAAAAATTTAATGGAGTTGAATGTTTTCACACTTCAATCCCTAGTTGTATCAACTGCGCTAATTCTTCTGTCAAACTCAACAACACTCGGCTACAAAGACTGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025343
ATGGAGTTGAATGTTTTCACACTTCAATCCCTAGTTGTATCAACTGCGCTAATTCTTCTGTCAAACTCAACAACACTCGGCTACAAAGACTGCAATTTTCCCGCCATTTTCAACTTCGGCGACTCAAATTCCGACACCGGCGGCCTATCGGCGGCGTTCGGCCAAGCTCCTCCACCCAACGGAGCCACATTCTTCCACTCCCCGTCCGGCCGCTACTGCGACGGCCGTCTCCTAATCGATTTCATAGCTGAAAGTGTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811056.1
MELNVFTLQSLVVSTALILLSNSTTLGYKDCNFPAIFNFGDSNSDTGGLSAAFGQAPPPNGATFFHSPSGRYCDGRLLIDFIAESVGLPYLSAFLDSIGANFRHGCNFATAGSTIRRQNTTIWQSGYSPISLDVQHLQFSDFLTRSQIFRRKGLFQKVLPEEDDFSRALYTFDIGQNDLTAGYKLNLSTEEVKAYVPDVLGQLSDVIKLIYSQGGRTFWIHNTGTVGCLPYVMDRFLVTAAQVDRNGCSAPYNDVSQHFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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