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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004299`

染色体: Chr05 坐标: 56706363-56709795 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004299`
名称	SmilChr05G004299
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RGLG2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56706363 - 56709795 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025352`
GeneID	`131025352`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025352`
原始查询	`LOC131025352`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RGLG2
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RGLG2
Arabidopsis	`AT5G14420` (RGLG2) RING domain ligase2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831293] identity=67.5; qcov=0.925; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0908700` (OsRFP) - identity=66.1; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07002 (Copine); PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025352

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811068.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057811068.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811068.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811068.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811068.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56706679`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr5:56706679`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr5:56707295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B60,B96,D10
`Chr5:56707310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:56707337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B130,B97,C23,C3
`Chr5:56707570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D3
`Chr5:56707917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B132,B8
`Chr5:56708028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr5:56708041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:56708048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B93,C52,C75
`Chr5:56708088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A16,B68,C16,C85
`Chr5:56708097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811068.1

429 aa

214

429

Copine

zf-C3HC4_3

PF07002 Copine 119-332 aa PF13920 zf-C3HC4_3 382-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811068.1`	Pfam	`PF07002`	Copine	Domain	119	332	3.1e-73	246.6	Copine
`XP_057811068.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	382	423	6.5e-07	29.8	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955085.1
GGGAAGTACTTATTATTTTAGATCTGAATTAGTACAAATCTATATATAAGCTCCGAATTAATGTAAACAATATATAGATAAGTAAGTTGAATTCTTCCAACAAAGAAAAAAAAAACATATTATATATATGTATGCATATATTAGCAAGCATACAAACCAACTCTGCAAAAACGAAAGAAAAAAAAAATCATTCTCCAAGTTGAATATACATTTTCTCAGTTTCACATAAAACACACACACACACACACAGTTTTAGGTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025352
ATGGGGAACAAGAATTCAAGTGGAAGAAGATTATTCTTCAATTCATCATCTTCATTTGATCATGATTCTGATCATGCCTACCGCCTGCCGCCTCTTTCTTACAGCAGCACGCCGCGCCACCCGTGCTGCACGCCCCGCCACCACCACGCCCCGGCGGCTTACAGCTACGCCCCGTCTCCGCCGCCCCGCCGCCGCCTCGACCGGAAGTTCTCGAGGATTGCTGATAACTACCAAACCCTCAATCAGGTTACGGATGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811068.1
MGNKNSSGRRLFFNSSSSFDHDSDHAYRLPPLSYSSTPRHPCCTPRHHHAPAAYSYAPSPPPRRRLDRKFSRIADNYQTLNQVTDALSRSGLESSNLIVGIDFTKSNEWTGARSFNRKSLHTIGSRLNPYEQAISIIGKTLSDFDDDNLIPCFGFGDASTHDQDVFSFYADGRFCEGFEEVLTRYRELVPQLRLSGPTSFAPVIEMAMSIVDKSRGQYHVLLIIADGQVTRSVDTPDGQLSPQERQTVDAIVRASYYPLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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