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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004303`

染色体: Chr05 坐标: 56728059-56731931 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004303`
名称	SmilChr05G004303
描述	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56728059 - 56731931 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025354`
GeneID	`131025354`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025354`
原始查询	`LOC131025354`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
产物	protein SIEVE ELEMENT OCCLUSION B-like
Arabidopsis	`AT3G01680` (SEOR1) sieve element occlusion amino-terminus protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821097] identity=34.6; qcov=1.03; evalue=1.61e-130; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0010088 (phloem development)
KEGG	-
Pfam	PF14576 (SEO_N); PF14577 (SEO_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025354

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811070.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811070.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057811070.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811070.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811070.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56728417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:56728449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B91
`Chr5:56728455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B139
`Chr5:56728501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:56728505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B61,C35,D6
`Chr5:56728641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B7
`Chr5:56728682`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B19
`Chr5:56728682`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B19
`Chr5:56728685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B139,C49
`Chr5:56728716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:56728718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B48,B77,D4
`Chr5:56728749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B56,B96,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811070.1

739 aa

370

739

SEO_N

SEO_C

PF14576 SEO_N 17-71 aa PF14576 SEO_N 113-349 aa PF14577 SEO_C 507-738 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811070.1`	Pfam	`PF14576`	SEO_N	Family	17	71	4.1e-79	266.5	Sieve element occlusion N-terminus
`XP_057811070.1`	Pfam	`PF14576`	SEO_N	Family	113	349	4.1e-79	266.5	Sieve element occlusion N-terminus
`XP_057811070.1`	Pfam	`PF14577`	SEO_C	Family	507	738	4.1e-78	262.7	Sieve element occlusion C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955087.1
ACAACCAACTCTCCTCTCCTCTCAATACAACACACACATCTCCACTCCTTTTTTGATGGCGAGTCGCGATCCCGCGGCAACCACCTAGAACCCCCCATTGACCGGGGGAGAAGCTGCCGTAGGGAGCCAAAACCCCGGCTCTGAGTGGATCAGGAGCATCCACTCAGAACCTTCTCGATCACAGGATCCACACTCCTATAGTGGATCACGTACAGTTTGAGGCCTAGCCACGAACTCGATCACGTCTCCACGAAGCCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025354
ATGACTACTCGGCGCCACCCGATGTCTGGGGAGCGCGGCTTCTTCTTGTCCGACGAGAGTGCCCTCAACAACCAGATTCAGGCGACTCACTTACCCGACATGGAGGATATCAACGTGAGGCCGATCCTCATCATCATCGAGGACATCATGCGCCTCACCCAGCCTTCAGGCGACGCTCATGCTACTACAACTATTACTGCTACTACTCATGTGGCTCAGGCTCATCCTCTCTTGGACAAGTCGACCGATAAGGTTTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811070.1
MTTRRHPMSGERGFFLSDESALNNQIQATHLPDMEDINVRPILIIIEDIMRLTQPSGDAHATTTITATTHVAQAHPLLDKSTDKVSHGGAYYDEKSYQTTYCDEKAYHQPSYRDEKAFHKTSYLEAEIVKVLACPINRVSCEIVCKIAGGGESHQVTMDLLRSLTSYAWEAKIVIALAAFAINYGEFWVVEHLHIKNPLAKNIATLEDLPDTLAMAGGGEPRKQFDAVIHLLTKILEVTHCIIKFKELPPLYISAQSPEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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