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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004310`

染色体: Chr05 坐标: 56789927-56791321 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004310`
名称	SmilChr05G004310
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56789927 - 56791321 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025361`
GeneID	`131025361`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025361`
原始查询	`LOC131025361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
Arabidopsis	`AT1G69870` (NRT1.7) nitrate transporter 1.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843323] identity=56; qcov=1.01; evalue=1.01e-151; confidence=high
Rice	`Os01g0913300` (OsNRT1.7) - identity=51.5; qcov=1.03; evalue=1.89e-137; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025361

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057811075.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811075.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811075.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811075.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56790128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C26,C81
`Chr5:56790141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B82
`Chr5:56790155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A3,B14
`Chr5:56790160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B12,B40,D5
`Chr5:56790250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B87,B95,C14,C52
`Chr5:56790254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:56790266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:56790275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C50
`Chr5:56790287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C45,C76
`Chr5:56790323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B57,B67,B86
`Chr5:56790337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr5:56790341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811075.1

365 aa

182

365

PTR2

PF00854 PTR2 3-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811075.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	3	364	1.3e-72	245.6	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955092.1
TAATGGAGAAGGGCAGACTCCAAAATGAATAACTAATTAGATAGTTGTCCTTGTTAACCAATTTTAGGAGTTAACAATTACTTGCAACAATCATCAAATAATCTTTGCCCACATCCAAAATCATGGAGATGGCGATGTTAATTATCATGGTTATGTACAACATAATTATTGAACTAGTGCGCGCATGCAGGGCATGGTGACGTTGACCATAATAGCAGGGGTGCCTCAGTTGCGGCCTCCGCCATGCATTAATCAAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025361
ATGCAGGGCATGGTGACGTTGACCATAATAGCAGGGGTGCCTCAGTTGCGGCCTCCGCCATGCATTAATCAAAAATGCAGCGCTCCCACCAAATCCCAGCTGGGAGTCCTGGCGCTGGGCCTCGGCTTTCTGTCCGTCGGCACCGGCGGCATCAGGCCGTGCAACATCCCTTTTGGCGTCGACCAGTTCGACGCCTCCACGGCGGAAGGGAGGAGAGGAATCAACAGCTTCTTCAACTGGTATTACATGTCCTTCACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811075.1
MQGMVTLTIIAGVPQLRPPPCINQKCSAPTKSQLGVLALGLGFLSVGTGGIRPCNIPFGVDQFDASTAEGRRGINSFFNWYYMSFTLVMTIALTLVVYIQDSVSWVWGFGIPTALMLFAIVLFFVGTNFYVYVVPEGSVFTAIAQVIAATYNKRKLHIPDAAAYFDPPLKGTLVTKLSLTNNLRFFNKAALITEGDIGVDGSNSNPWRLCNVQKVEETKCLFKIIPIWASGIIYFTAIVQQSTFILSQALTMDRHLGPNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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