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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004319`

染色体: Chr05 坐标: 56843286-56845448 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004319`
名称	SmilChr05G004319
描述	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56843286 - 56845448 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025370`
GeneID	`131025370`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025370`
原始查询	`LOC131025370`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
产物	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
Arabidopsis	`AT1G67730` (KCR1) beta-ketoacyl reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843098] identity=45.3; qcov=0.958; evalue=2.62e-105; confidence=high
Rice	`Os04g0483500` (KCR1) - identity=56.5; qcov=0.858; evalue=3.59e-113; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0045703 (ketoreductase activity)
KEGG	smil00062 (Fatty acid elongation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01040 (Biosynthesis of unsaturated fatty acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025370

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811087.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057811087.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811087.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811087.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56843408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C21,D1
`Chr5:56843545`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C87
`Chr5:56843545`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C87
`Chr5:56843561`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A8,B129,B4,B71,C37,D7
`Chr5:56843587`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B133
`Chr5:56843587`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B133
`Chr5:56843804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B78,D5
`Chr5:56843804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D5
`Chr5:56844812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr5:56844875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:56845007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B99,C45
`Chr5:56845025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B99,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811087.1

332 aa

166

332

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 47-242 aa PF13561 adh_short_C2 54-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811087.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	47	242	5e-38	131.3	short chain dehydrogenase
`XP_057811087.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	54	268	5.1e-21	76.1	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955104.1
AATCCTAAACCCCTCGATTATATCGCTTAGCATCATTATATAATCATCACCACTCTGCATCTGCATCCATCTCCAGATTCTCCGCTCATGGAGATTCAAACCCTTTTCATACTCACCGCCGCCTTCTTCGGCTTCATCAACCTCTCAAAATTCCTACTAAAAATCCTCGTATCGCTATGGGCGGCGTTCATCCGGCCGGAAAAGGATCTCAGATCGTACGGATCCTGGGTCGCCATCACCGGCTCAACCGACGGCATCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025370
ATGGAGATTCAAACCCTTTTCATACTCACCGCCGCCTTCTTCGGCTTCATCAACCTCTCAAAATTCCTACTAAAAATCCTCGTATCGCTATGGGCGGCGTTCATCCGGCCGGAAAAGGATCTCAGATCGTACGGATCCTGGGTCGCCATCACCGGCTCAACCGACGGCATCGGGAGAGCCCTAGCTTTCGAAATCGCGGCGAGAGGCCTCAACCTCGTGCTCATAGGCCGGAATCCTTCGAAGCTGGAGGCGACGTCGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811087.1
MEIQTLFILTAAFFGFINLSKFLLKILVSLWAAFIRPEKDLRSYGSWVAITGSTDGIGRALAFEIAARGLNLVLIGRNPSKLEATSREIRRKHGGIEVKTVAIDFAAGCRSGEEIARAVEREIKGLDLGILINNAGLAYPYARFMHEVDDGLMESVVGVNAAALTWLTRAAVAGMLERRRGAIVNVGSGSSACLPSYPLYTVYAATKAYVTMLSKSMSLEYKQHGIDVQCQIPLLVATKMSSIKKSSLFIPSAETYSKAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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