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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004320`

染色体: Chr05 坐标: 56856445-56859286 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004320`
名称	SmilChr05G004320
描述	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56856445 - 56859286 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025372`
GeneID	`131025372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025372`
原始查询	`LOC131025372`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
产物	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
Arabidopsis	`AT1G67730` (KCR1) beta-ketoacyl reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843098] identity=43.8; qcov=0.931; evalue=2.49e-100; confidence=medium
Rice	`Os04g0483500` (KCR1) - identity=51.9; qcov=0.861; evalue=5.72e-101; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0045703 (ketoreductase activity)
KEGG	smil00062 (Fatty acid elongation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01040 (Biosynthesis of unsaturated fatty acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811089.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057811089.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811089.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811089.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56856662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B74,C13,C57
`Chr5:56856669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:56856679`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,B8,B81,C19,C85
`Chr5:56856679`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A2,B8,B81,C19,C85
`Chr5:56858718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B99
`Chr5:56858731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B8,B81,C19,C45,C85
`Chr5:56858920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr5:56858947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B123
`Chr5:56858949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C28
`Chr5:56858952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:56858973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr5:56859161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811089.1

331 aa

166

331

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 47-242 aa PF13561 adh_short_C2 54-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811089.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	47	242	6e-37	127.7	short chain dehydrogenase
`XP_057811089.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	54	245	5.7e-22	79.2	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955106.1
ATTGAATATTCACCTGTATTAGTATTACTCGACACTGCATCTGCATCCATCTCTAGATTCTCCGCTAATGGAGATTCAAGCCCTTTTCATACTCACCGCCGCCTGCTTCGGCTTCATCAATCTCTCAAAATTCCTACTAAAAATCCTCGTATCGCTATGGGCCGCGTTCATCCGGCCGGAAAAAGATCTGAGATCGTACGGCTCCTGGGCCGCCATCACCGGCTCAACCCAGGGCATCGGGAGAGCCCTAGCTTTCGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025372
ATGGAGATTCAAGCCCTTTTCATACTCACCGCCGCCTGCTTCGGCTTCATCAATCTCTCAAAATTCCTACTAAAAATCCTCGTATCGCTATGGGCCGCGTTCATCCGGCCGGAAAAAGATCTGAGATCGTACGGCTCCTGGGCCGCCATCACCGGCTCAACCCAGGGCATCGGGAGAGCCCTAGCTTTCGAGATCGCGGCGAGAGGCCTCAACCTCGTGCTGATCGACCTCAACCCTTCGACGCTGGAGGCGACGTCGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811089.1
MEIQALFILTAACFGFINLSKFLLKILVSLWAAFIRPEKDLRSYGSWAAITGSTQGIGRALAFEIAARGLNLVLIDLNPSTLEATSREIRRKHGGIEVKTVAIDFAAGCRAGEEIARAVAREIKGLDLGILINNAGMAYPYARFMHEVEDGLMESVVGVNAAAATWVARAAVAEMLGRGRGAVVNIGSGSSAYVPSYPLFTVYAATKAYVAMLSKSMSLEYKQHGINVQCQIPMFVATKMTSIKKPSLFIPSAETYSKAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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