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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004327`

染色体: Chr05 坐标: 56926696-56928175 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004327`
名称	SmilChr05G004327
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56926696 - 56928175 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025380`
GeneID	`131025380`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025380`
原始查询	`LOC131025380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
产物	stemmadenine O-acetyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=43.4; qcov=1.01; evalue=3e-125; confidence=medium
Rice	`Os04g0500700` (OsHCT1) hydroxycinnamoyltransferase 1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4336306] identity=29.7; qcov=1.04; evalue=3.21e-46; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025380

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811098.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811098.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811098.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811098.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56926774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B28,B40,C74
`Chr5:56926778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,A9,C24,C39
`Chr5:56926800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C21
`Chr5:56926805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr5:56926874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:56926889`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A16,A25,A4,B125,B127,B136,B14,B27,B43,B45,B61,B81,B90,B94,C10,C21,C30,C36,C45,C53,C72,C80,D2
`Chr5:56926925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr5:56926943`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A16,A25,A8,B125,B127,B136,B137,B14,B27,B43,B45,B61,B90,B94,C10,C21,C30,C36,C45,C50,C53,C80,C87,D2,D8
`Chr5:56926980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr5:56926994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr5:56927000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,D7
`Chr5:56927005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811098.1

425 aa

212

425

Transferase

PF02458 Transferase 4-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811098.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	4	410	3.2e-79	267.4	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955115.1
TTCATAAAGAGAAACCAAAACCTTTCATCAAATTTAATTTCTTCTCATCAAAATGGAGATCGAAATAAAAGTAATCTCCACAGAAATCATCAAACCATCTTCTCCAACTCCAAAATCACTGCAAAAACACTACCTATCATTTCTCGATCAACTCGCTCCACCCCTCTTCATGCCTCTCGTCTACTTCTACTCATCAAACCCTAAAATCCCCAATTCCCAAAAATCAGACCACCTCAAGAAATCCTTGTCGGAAACCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025380
ATGGAGATCGAAATAAAAGTAATCTCCACAGAAATCATCAAACCATCTTCTCCAACTCCAAAATCACTGCAAAAACACTACCTATCATTTCTCGATCAACTCGCTCCACCCCTCTTCATGCCTCTCGTCTACTTCTACTCATCAAACCCTAAAATCCCCAATTCCCAAAAATCAGACCACCTCAAGAAATCCTTGTCGGAAACCCTCTCCAGATTCTACCCCCTCGCCGGCCGCCTCGCCGACAACCTCCACGTCGACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811098.1
MEIEIKVISTEIIKPSSPTPKSLQKHYLSFLDQLAPPLFMPLVYFYSSNPKIPNSQKSDHLKKSLSETLSRFYPLAGRLADNLHVDCNDGGAPFSEAEADCDLSQAITNPNPKGMNKFLPLSLNQSLGFCMAAQATYFRCGGVAVGLLISHKIADALSFFSFANSWSAAARGGGAGDPPFPKFDAAAYFPAREINGYIPSSRMMKEELATKIFTFPTKKIAILRERYAAGAGEWPTRVEALSAFIWSRFISATGMRADPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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