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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004363`

染色体: Chr05 坐标: 57177963-57186116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004363`
名称	SmilChr05G004363
描述	uncharacterized SmilChr05G004363
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57177963 - 57186116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025412`
GeneID	`131025412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025412`
原始查询	`LOC131025412`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Zn-dependent exopeptidases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843062]; symbol=AT1G67420; hit=AT1G67420; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Zn-dependent exopeptidases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843062]; symbol=AT1G67420; hit=AT1G67420; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G67420` (AT1G67420) Zn-dependent exopeptidases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843062] identity=57.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0295800` - identity=57; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008235 (metalloexopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04389 (Peptidase_M28); PF22248 (ERMP1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811147.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057811147.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811147.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811147.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57178403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B91
`Chr5:57178443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:57178828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:57179448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr5:57179450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B22,B51,C10
`Chr5:57179480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:57181999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:57182154`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A11,B101,B106,B114,B117,B131,B138,B21,B31,B34,B37,B53,B56,B78,B79,B8,B87,C13,C33,C36,C4,C47,C64,C66,D2
`Chr5:57182221`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A4,A9,B1,B102,B119,B125,B127,B63,B75,B79,C16,C26,C36,C4,C48,C56,C6,C64,C7,C73,C76,C84,D5,D7,D9
`Chr5:57182263`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A5,A7,A8,B102,B122,B17,B22,B35,B46,B50,B57,B81,B89,C53,C6,C63,D10,D3,D4
`Chr5:57182424`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A1,A10,A19,A21,A25,A7,A9,B10,B100,B109,B111,B112,B114,B115,B120,B122,B128,B132,B135,B136,B140,B17,B18,B21,B22,B24,B26,B3,B36,B38,B39,B44,B53,B6,B61,B65,B66,B70,B74,B75,B79,B85,B89,C10,C11,C18,C19,C22,C25,C27,C28,C29,C3,C34,C38,C46,C49,C50,C52,C65,C67,C68,C69,C77,C8,C86,C87,D1,D3,D4,D6
`Chr5:57182491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811147.1

876 aa

438

876

Peptidase_M28

ERMP1_C

PF04389 Peptidase_M28 131-324 aa PF22248 ERMP1_C 651-874 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811147.1`	Pfam	`PF04389`	Peptidase_M28	Domain	131	324	1.2e-41	143.3	Peptidase family M28
`XP_057811147.1`	Pfam	`PF22248`	ERMP1_C	Domain	651	874	5.4e-27	95.4	Endoplasmic reticulum metallopeptidase 1, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955164.1
TGAATTGCTTGAGGAGCAACAAATCAGCGGTCTGACTAAAAACACTACACTGCAACTGCTGCAACCATTGTTAAACCTCTCTCAGCTCCGGCAATCGGCGGCGTTGTGATGTCGTTAATGAGGCTGAGCTCCGGCGACCTCGCCGGATTCAAAGTCCTCTTCGCGCTGATGATTCTGTACGGAGTGTCATCTTACTTAGCTTACTCCGCCATCCACATGAAGTTCGTCGCGCCTCTCGGCGCCGACGCGCCGCTCGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025412
ATGTCGTTAATGAGGCTGAGCTCCGGCGACCTCGCCGGATTCAAAGTCCTCTTCGCGCTGATGATTCTGTACGGAGTGTCATCTTACTTAGCTTACTCCGCCATCCACATGAAGTTCGTCGCGCCTCTCGGCGCCGACGCGCCGCTCGATCGGTTCTCCGAGGCCAGAGCGATTGAGCACGTGCGCGTGCTGGCAGAGGAGATTGGCGGCCGCCAGGTGGGAACTCCAGGTCTGACACAGGCAGCAGCATATATTAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811147.1
MSLMRLSSGDLAGFKVLFALMILYGVSSYLAYSAIHMKFVAPLGADAPLDRFSEARAIEHVRVLAEEIGGRQVGTPGLTQAAAYIKKQLELIRERAGSNLRIEIEETVVNGSFNMMFLGNSLSLTYRNHTNIVMRISSVDSQESDPSVLLNGHFDTPPGSPGAGDCGSCVASLLEVARLGIDSGWIPPRPIIFLFNGAEELFMLGSHGFMTTHRWRDTVGAFIDVEASGTGGFDLVCQSGPGSWPSSVYAQSAIYPMANS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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