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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004366`

染色体: Chr05 坐标: 57199655-57202054 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004366`
名称	SmilChr05G004366
描述	uncharacterized SmilChr05G004366
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57199655 - 57202054 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025416`
GeneID	`131025416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025416`
原始查询	`LOC131025416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0483900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0483900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G67400` (AT1G67400) ELMO/CED-12 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843060] identity=69; qcov=1.01; evalue=2.15e-135; confidence=high
Rice	`Os11g0483900` - identity=74.7; qcov=0.889; evalue=7e-138; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04727 (ELMO_CED12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811149.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811149.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811149.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811149.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57199722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B103,B107,B22,B51
`Chr5:57200776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C6,D1
`Chr5:57200800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:57201272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B94,C61
`Chr5:57201630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,C10,C74,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811149.1

271 aa

136

271

ELMO_CED12

PF04727 ELMO_CED12 77-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811149.1`	Pfam	`PF04727`	ELMO_CED12	Family	77	242	1.8e-52	178.6	ELMO/CED-12 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955166.1
AGAGATAGAGAGAGAGAGGGATTAGATTAGTTGCAGTTGAAGATGAGCGAAGAGAGAATCAATGGCGGCTGCATTGCAGCCCGCAGCTTCACGCATTCATCGTCTTTCTCTAAGTGCACGCATTCTCACTCTTCGATTCAAGATTATGCAGCTTGTGGTACACCTGCAGCATGGAGAGGGAAAAGCATGACTTGTGTTTGCTTTAAGCGAAAGGGAAGCCAAGCCCGGATTTGCCTAAACTTGACACCCTTACAGGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025416
ATGAGCGAAGAGAGAATCAATGGCGGCTGCATTGCAGCCCGCAGCTTCACGCATTCATCGTCTTTCTCTAAGTGCACGCATTCTCACTCTTCGATTCAAGATTATGCAGCTTGTGGTACACCTGCAGCATGGAGAGGGAAAAGCATGACTTGTGTTTGCTTTAAGCGAAAGGGAAGCCAAGCCCGGATTTGCCTAAACTTGACACCCTTACAGGAAGAGAGGCTCAAAAGGTTGAGACACCGAACTAAAGTCCAGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811149.1
MSEERINGGCIAARSFTHSSSFSKCTHSHSSIQDYAACGTPAAWRGKSMTCVCFKRKGSQARICLNLTPLQEERLKRLRHRTKVQFDASRLQHQEALRALWSATYPGEELESLISDKWKEMGWQGKDPSTDFRGAGFISLENLLFFAKTFSHSFQSLLRKQTGKRAMWEYPFAVAGVNITFMILQMLDLDATKPPSFMRAVFLQMLSENEWAFDLLYCVAFMVMDKLWLDKHATYMEFNDILRSTRSQLEKEFLMDDVLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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