当前解析结果
SmilChr05G004373| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004373 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004373 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G004373 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 57265043 - 57266859 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025421 |
|---|---|
| GeneID | 131025421 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025421 |
| 原始查询 | LOC131025421 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0590366- identity=25.1; qcov=1.07; evalue=3.28e-10; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025421 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811163.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811163.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811163.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811163.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057811163.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:57265659 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,C80 |
Chr5:57265687 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,B11 |
Chr5:57265770 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A16 |
Chr5:57265785 |
T |
TTG |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 1 | C29 |
Chr5:57265785 |
T |
TTG |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr5:57265797 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A16 |
Chr5:57265797 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A16 |
Chr5:57266048 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,B71 |
Chr5:57266068 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,B37,C42 |
Chr5:57266124 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A7,B137,B21,B65,C20,C23,C32,D10 |
Chr5:57266128 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B58,B79,C52 |
Chr5:57266149 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B11,B125,C20,C7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。