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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G004382

染色体: Chr05 坐标: 57310871-57311622 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G004382
名称SmilChr05G004382
描述uncharacterized SmilChr05G004382
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向57310871 - 57311622 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131025430
GeneID131025430
locus_tag-
NCBI NameLOC131025430
原始查询LOC131025430

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839619]; symbol=AT1G27300; hit=AT1G27300; species=arabidopsis; confidence=low
产物uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839619]; symbol=AT1G27300; hit=AT1G27300; species=arabidopsis; confidence=low
ArabidopsisAT1G27300 (AT1G27300)
uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839619]
identity=33.9; qcov=0.772; evalue=6.75e-16; confidence=low
RiceOs02g0509600
-
identity=32.5; qcov=0.786; evalue=8.03e-15; confidence=low
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131025430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus membrane 核膜 0.60000 XP_057811186.1
2 Endoplasmic reticulum 内质网 0.40000 XP_057811186.1
3 Nucleus 细胞核 0.20000 XP_057811186.1
4 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 0.20000 XP_057811186.1
5 Chloroplast 叶绿体 0.20000 XP_057811186.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr5:57311401 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B104,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057955203.1
CATCTAGAGCGAAAGAAAGAGATGGGATCAAACAGAAAAGGTGGAGATGAGAGAGAGAGAGCCATAAGGAAAAACGAATGGAGGAAGAAGAAAGCAACAGCACCAAACTCTCCTCCATCGGAAGCAAGCCCTTGTCCGAGGTAGAGTCGTCATCGGAAGAAGAGGATAGACATGCAAGAGATGATGATGATGAAGAAACGTCCAACAAAGAGATTATCAAAGAGCTCAAGAACATACAGCGGCAGAACACAATCACTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131025430
ATGGAGGAAGAAGAAAGCAACAGCACCAAACTCTCCTCCATCGGAAGCAAGCCCTTGTCCGAGGTAGAGTCGTCATCGGAAGAAGAGGATAGACATGCAAGAGATGATGATGATGAAGAAACGTCCAACAAAGAGATTATCAAAGAGCTCAAGAACATACAGCGGCAGAACACAATCACTCATTATCTCCTCACAGTTTCAATTCTGGTGACCGTGGCATGGCAGCTCTCAGAATTTTCTCTCATTTTGAGAATCAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057811186.1
MEEEESNSTKLSSIGSKPLSEVESSSEEEDRHARDDDDEETSNKEIIKELKNIQRQNTITHYLLTVSILVTVAWQLSEFSLILRIKQGFNNPLKSIGGAIKALLNTSTQDNEQKQTQVMPPTYLPGLKIPDFPGFDTSNEEDDDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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