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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004397`

染色体: Chr05 坐标: 57400496-57401676 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004397`
名称	SmilChr05G004397
描述	delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, peroxisomal
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57400496 - 57401676 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025443`
GeneID	`131025443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025443`
原始查询	`LOC131025443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, peroxisomal
产物	delta(3%2C5)-Delta(2%2C4)-dienoyl-CoA isomerase%2C peroxisomal
Arabidopsis	`AT5G43280` (DCI1) delta(3,5),delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834346] identity=69.9; qcov=0.989; evalue=1.55e-143; confidence=high
Rice	`Os01g0925200` (P0482D04.4) - identity=52; qcov=0.978; evalue=5.8e-103; confidence=high
GO	GO:0005777 (peroxisome); GO:0051750 (delta(3,5)-delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase activity)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00378 (ECH_1); PF16113 (ECH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057811209.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811209.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811209.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811209.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57400952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B38,B39,C13
`Chr5:57400993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr5:57401098`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,B108,B17,B45,C84,C86
`Chr5:57401172`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B19
`Chr5:57401172`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811209.1

279 aa

140

279

ECH_1

ECH_2

PF00378 ECH_1 20-277 aa PF16113 ECH_2 25-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811209.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	20	277	2.8e-46	158.6	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057811209.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	25	201	6.2e-29	102.3	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955226.1
AAAAAAGCATTCCTTTCAAAATTCCAAGTAAAAGACGTTCTAATGGGCCTTGAATTGTGAGAAAATGGGCCGCGAACTAGGCCCACATAGCCTTCGCTTCTCTTATCTCCATCCTCATCAATATACATATATTTACTAATAATAATAATAATAGTAAATCAACATAGAAAAGGGGAGATGGAAGAGGTGATTCCCAATTACAAAACCCTGCAAATCAATCGGAAATCGCCCAACTCAAGAGTGTTCCATCTGCTGATCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025443
ATGGAAGAGGTGATTCCCAATTACAAAACCCTGCAAATCAATCGGAAATCGCCCAACTCAAGAGTGTTCCATCTGCTGATCAACCGCCCCTCACGCGGCAACGCCCTCTCAGCCGACTTCTTCACGGAGTTCCCCCATGCTCTCTCCTCCCTCGACCGCAACCCCGAGGTCGCCGTCATCGTCCTCTCCGGCGCCGGGAAGCACTTCTGCACCGGGATCGACCTCCACCTCCTCAACTCCACTACTATGGATACCGGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811209.1
MEEVIPNYKTLQINRKSPNSRVFHLLINRPSRGNALSADFFTEFPHALSSLDRNPEVAVIVLSGAGKHFCTGIDLHLLNSTTMDTGSADEGRTREKLRRQIKSMQRAVTAVEECRKPVIAAVHGACIGGGVDIITACDLRYCTEEAEFSVKEVDLAITADLGTLQRLPGIVGFANAMELALTARHFSGSEAKSLGLVSQVFGDRAAMDKGVAQVAEGIAGRSPLAIIGTKRVLIESRDMALQQGLDYVATWNSAVLLSHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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