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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000751`

染色体: Chr05 坐标: 5811765-5812490 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000751`
名称	SmilChr05G000751
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	5811765 - 5812490 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025456`
GeneID	`131025456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025456`
原始查询	`LOC131025456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
产物	NAC domain-containing protein JA2-like
Arabidopsis	`AT4G27410` (RD26) NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828849] identity=32.8; qcov=0.734; evalue=2.15e-13; confidence=low
Rice	`Os01g0816100` (OsNAC4) - identity=30.8; qcov=0.701; evalue=8.33e-14; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0048731 (system development)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811231.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811231.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811231.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811231.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811231.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:5811779`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B38,C26,C29,C58,C87
`Chr5:5811779`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B38,C26,C29,C58,C87
`Chr5:5811782`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B38,C26,C29,C58,C87
`Chr5:5811782`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B38,C26,C29,C58,C87
`Chr5:5811794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr5:5811799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr5:5811801`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C29
`Chr5:5811801`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C29
`Chr5:5811807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:5811872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C57
`Chr5:5811872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr5:5811876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811231.1

241 aa

120

241

NAM

PF02365 NAM 6-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811231.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	6	144	2.7e-21	77.0	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955248.1
ATGGCGATGAATATTCCCATTGGTTTCCGTTTCATCCCGACCGATGAGGAGTTGATCGGAGGTTTTCTATGGCCGAGACTCATGGGAATGGAGCTGCCGTGGAACGGCATAGTCGAGAAGGATATCTACGGCGACAACGCAGAGCCGTGGAAGGTTTTTTCCGACGTCGTCGATGGCTGGCAAACGAAGAAGGAGGGCAGCGCCATCAAGAGCTCCATCTACGCCTTCACCACGCTCAAGAACGTTCCCAACTCCAAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025456
ATGGCGATGAATATTCCCATTGGTTTCCGTTTCATCCCGACCGATGAGGAGTTGATCGGAGGTTTTCTATGGCCGAGACTCATGGGAATGGAGCTGCCGTGGAACGGCATAGTCGAGAAGGATATCTACGGCGACAACGCAGAGCCGTGGAAGGTTTTTTCCGACGTCGTCGATGGCTGGCAAACGAAGAAGGAGGGCAGCGCCATCAAGAGCTCCATCTACGCCTTCACCACGCTCAAGAACGTTCCCAACTCCAAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811231.1
MAMNIPIGFRFIPTDEELIGGFLWPRLMGMELPWNGIVEKDIYGDNAEPWKVFSDVVDGWQTKKEGSAIKSSIYAFTTLKNVPNSKRISRRAGGGTWGGQTGPKKIIRSDTGEIIGHSKMFSFERDDKAAPEDFGHWIMHEYSLSGRANGGDLVVCKITNCIKVSAASKKRAAQIDQDQLAVGFKKQKILFPAVEEEGFIVGDQSGQALDVDDDFVQSLIAGLDVEFVGGAGDESWLSAQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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