当前解析结果
SmilChr05G000782| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000782 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000782 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000782 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 6098239 - 6100619 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025457 |
|---|---|
| GeneID | 131025457 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025457 |
| 原始查询 | LOC131025457 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025457 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811232.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057811232.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057811232.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811232.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811232.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:6098243 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B13,B33,B35,D11,D4 |
Chr5:6098301 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B17,B51,B82,C59 |
Chr5:6098324 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:6098329 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B134,B18,B97,C20,D7 |
Chr5:6098915 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr5:6098918 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B33,B35,D4 |
Chr5:6098981 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B111,B2 |
Chr5:6099038 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B13,B38,B39,B40 |
Chr5:6099066 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A16,D11 |
Chr5:6099094 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B17,B51,B82,C59 |
Chr5:6099208 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B13,B33,B35,D11,D4 |
Chr5:6099254 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。