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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000822`

染色体: Chr05 坐标: 6455437-6458551 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000822`
名称	SmilChr05G000822
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g16250-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	6455437 - 6458551 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025459`
GeneID	`131025459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025459`
原始查询	`LOC131025459`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g16250-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At1g16250-like
Arabidopsis	`AT1G16250` (AT1G16250) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838194] identity=31.6; qcov=0.646; evalue=5.89e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0171600` (OsFBK12) - identity=42.1; qcov=0.396; evalue=1.96e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01344 (Kelch_1); PF07646 (Kelch_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811235.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811235.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811235.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811235.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:6455474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	158	A1,A10,A14,A15,A18,A2,A21,A22,A23,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B111,B115,B118,B12,B121,B123,B124,B126,B127,B128,B130,B131,B133,B136,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B24,B25,B26,B28,B3,B31,B32,B33,B34,B4,B40,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B6,B61,B62,B63,B65,B67,B68,B7,B70,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B90,B91,B92,B95,B96,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C16,C18,C20,C23,C24,C26,C27,C28,C30,C32,C34,C36,C37,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C51,C52,C53,C57,C58,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D7,D8
`Chr5:6455530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr5:6457958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr5:6458031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C27,C28
`Chr5:6458111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:6458139`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B112,C54
`Chr5:6458139`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B112,C54
`Chr5:6458161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:6458165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B93,D11
`Chr5:6458168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:6458206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:6458223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811235.1

240 aa

120

240

Kelch_2

Kelch_1

PF07646 Kelch_2 52-99 aa PF01344 Kelch_1 52-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811235.1`	Pfam	`PF07646`	Kelch_2	Repeat	52	99	4.3e-15	55.5	Kelch motif
`XP_057811235.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	52	100	6.4e-23	80.6	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955252.1
ATGGCATCTATCGGCGACTCCATTTACATGATCGGAGGCAGAATTTGTCGCAAGGACAACGAACATTCCGATGTAGAAGTTGAAGTCCGGCCGACGGTGATGCGCTACAATGTTGGCACGGACCAATGGTCCGTTTGTGCACCCCTATCTCGACCGAGGTACAATTTCGCATGCACGGTATGCAACGACAAGATATACGTTGCCGGGGGGCAGTATGAGCTGGCAAGTGCTAGGAGCACCTCATCCGTCGAGGTGTACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025459
ATGGCATCTATCGGCGACTCCATTTACATGATCGGAGGCAGAATTTGTCGCAAGGACAACGAACATTCCGATGTAGAAGTTGAAGTCCGGCCGACGGTGATGCGCTACAATGTTGGCACGGACCAATGGTCCGTTTGTGCACCCCTATCTCGACCGAGGTACAATTTCGCATGCACGGTATGCAACGACAAGATATACGTTGCCGGGGGGCAGTATGAGCTGGCAAGTGCTAGGAGCACCTCATCCGTCGAGGTGTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811235.1
MASIGDSIYMIGGRICRKDNEHSDVEVEVRPTVMRYNVGTDQWSVCAPLSRPRYNFACTVCNDKIYVAGGQYELASARSTSSVEVYDPMDDKWTQLPNMRRLRYKCVGVTWKGKVHVVGGFVQGCEVECQLGYVDRCSAEVYDGEGQWDLVPGMWQLDVPPNQIVDVEGKLFSSGDCLSVWKGHIEIYDGNSNFWNVFEALFVIESVGLLEELNFRWDLIIRVIDTEIWSKKESASMIEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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