当前解析结果
SmilChr05G000950| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000950 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000950 |
| 描述 | high mobility group B protein 6-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 7676671 - 7677216 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025470 |
|---|---|
| GeneID | 131025470 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025470 |
| 原始查询 | LOC131025470 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | high mobility group B protein 6-like |
| 产物 | high mobility group B protein 6-like |
| Arabidopsis | AT5G01910 (AT5G01910)myelin transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831775] identity=45.9; qcov=0.753; evalue=6.03e-23; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025470 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811249.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057811249.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057811249.1 |
| 4 | Spindle | Spindle | 1.00000 | XP_057811249.1 |
| 5 | Spindle pole | Spindle pole | 1.00000 | XP_057811249.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:7676859 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,B138,B20,C61 |
Chr5:7676872 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr5:7676887 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B138,B20,C61 |
Chr5:7676915 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,B90 |
Chr5:7676954 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C76,C80 |
Chr5:7676965 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
Chr5:7676996 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B52,C25 |
Chr5:7677013 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A22 |
Chr5:7677013 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr5:7677147 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr5:7677153 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B48 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。