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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001079`

染色体: Chr05 坐标: 8974888-8975435 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001079`
名称	SmilChr05G001079
描述	uncharacterized SmilChr05G001079
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	8974888 - 8975435 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025488`
GeneID	`131025488`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025488`
原始查询	`LOC131025488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025488

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811265.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811265.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811265.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811265.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811265.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:8974894`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A20,B109,B114,B127,B135,B15,B34,B41,B72,B83,B95,C23,C28,C41,C49,C60,C71,C72,C82
`Chr5:8974911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr5:8974920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr5:8975136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr5:8975136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:8975137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A14,A18,A20,A25,B105,B108,B115,B119,B120,B127,B136,B137,B16,B33,B44,B69,B7,B74,B76,B80,C24,C30,C46,C53,C55,C59,C71,C75
`Chr5:8975154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	B12,B131,B138,B18,B24,B29,B71,B73,B75,B78,B97,C16,C23,C70,C79,C83,C84,C85,D3
`Chr5:8975203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:8975206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:8975278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:8975286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:8975301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811265.1

150 aa

150

RVT_3

PF13456 RVT_3 43-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811265.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	43	95	8.8e-10	39.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955282.1
ATGGGGGCGGCTGCTAGGAAAGATTGGGTTGATGTGCAGCAGTTACGGAGCGGAGTCAAGAGTCGGACGATACCAAAGTGCAAAGGGTGGCATACCATTCAAGAAGGTTGGAGGAAATGCGGGGTGAACGCTGCGTTTTTCAATGAAGCGTGCTCGTCGGGGGCTGGTATGGTTGTGAGGGATGTGAATGGCGTTTTTGTAAAGGTTAGAGCTGTGCGTTTTCATGGCTGTCCGAGTGTGGAGGAGGGTGAAGCTATGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025488
ATGGGGGCGGCTGCTAGGAAAGATTGGGTTGATGTGCAGCAGTTACGGAGCGGAGTCAAGAGTCGGACGATACCAAAGTGCAAAGGGTGGCATACCATTCAAGAAGGTTGGAGGAAATGCGGGGTGAACGCTGCGTTTTTCAATGAAGCGTGCTCGTCGGGGGCTGGTATGGTTGTGAGGGATGTGAATGGCGTTTTTGTAAAGGTTAGAGCTGTGCGTTTTCATGGCTGTCCGAGTGTGGAGGAGGGTGAAGCTATGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811265.1
MGAAARKDWVDVQQLRSGVKSRTIPKCKGWHTIQEGWRKCGVNAAFFNEACSSGAGMVVRDVNGVFVKVRAVRFHGCPSVEEGEAMSLREALSWIKEMVWIREMLDANDNYTVNFVRRDANKLAHLFARSSKDIVVANVWDESPAFVESL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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