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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001141`

染色体: Chr05 坐标: 9532331-9534729 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001141`
名称	SmilChr05G001141
描述	L10-interacting MYB domain-containing protein-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	9532331 - 9534729 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025496`
GeneID	`131025496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025496`
原始查询	`LOC131025496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L10-interacting MYB domain-containing protein-like
产物	L10-interacting MYB domain-containing protein-like
Arabidopsis	`AT5G05800` (AT5G05800) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830465] identity=33.5; qcov=0.796; evalue=1.63e-22; confidence=low
Rice	`Os12g0207200` - identity=28.1; qcov=0.83; evalue=5.74e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811273.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811273.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811273.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811273.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811273.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:9532509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B40,C84
`Chr5:9532726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A10,A15,B101,B102,B110,B125,B135,B16,B25,B28,B29,B32,B37,B41,B46,B60,B61,B67,B68,B75,B8,B89,B9,B92,B99,C1,C11,C15,C16,C27,C28,C33,C47,C55,C66,C69,D5,D7
`Chr5:9532801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B85
`Chr5:9532939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C24,D5
`Chr5:9532956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A24,B119,B125,B41,B61,B67,B8,C42,C52,C73,C9
`Chr5:9532980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B17,C5,C82
`Chr5:9533017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811273.1

206 aa

103

206

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 26-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811273.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	26	120	3.3e-21	76.8	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955290.1
AGGGTGTTTGGCTGAGCTTATAAGCTCCTTAAAACAGCTTATAAGCTGTTTAGGAGCTTATAAGCTCTTGAAAAGTGTTTGGCAAAATAAGCTATCTAGGAGCTTATAAGATGTAAAAATAAGCTCTAAGAGCTTATAAGCTCTAAAAAATAAAAGTTCCCCCACCCCAACTTATTTTTTGAGAGAGCTTATAAGCTGCATTAAATTTACTAAAATGACCTTGACATATTTTTGTATTTTCAATTATGCCCTTTCAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025496
ATGGAGAATCGTGATCAAGGAAATAAAGGAATCGTTGGTAAGATCAATAAAATGACCGATGGGTCATCTTCTGCTAAGTGGAATGACTACTTGAACCGTATATTTATTCAATTGTGTGTAGAAGAAATTGGGAAAGGCAATAGACCAAATAGTCACTTCAATGTGAATGGCTGGAATAATATTGTTAGAAAGTTTAATGAAATAACTGGTAAAAACCTTGTTTACAAGCAAATTCGAAATCATTGGGATGCAATGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811273.1
MENRDQGNKGIVGKINKMTDGSSSAKWNDYLNRIFIQLCVEEIGKGNRPNSHFNVNGWNNIVRKFNEITGKNLVYKQIRNHWDAMKKEWLSFKKLMHSETVIGWNPLKNSLDASEEWWSRKIRENVDFKKFKNKDLSLVWFEYDKLFSDVAATGERARAPSQRSENEFDVENEILGVDSEAKEVEDHVEIGDSEDVGLGGIVRMLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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