当前解析结果
SmilChr05G001242| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001242 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001242 |
| 描述 | uncharacterized protein At4g04775-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 10525287 - 10525772 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025506 |
|---|---|
| GeneID | 131025506 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025506 |
| 原始查询 | LOC131025506 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025506 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057811284.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057811284.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057811284.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.60000 | XP_057811284.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811284.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:10525315 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr5:10525318 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,C18,C23 |
Chr5:10525330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,C85 |
Chr5:10525346 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B21,B90 |
Chr5:10525359 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 147 | A1,A10,A11,A16,A18,A20,A21,A22,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B100,B102,B104,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B125,B127,B128,B13,B130,B132,B134,B138,B139,B14,B15,B17,B20,B25,B27,B3,B30,B32,B33,B36,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B60,B61,B62,B64,B65,B67,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B77,B8,B80,B82,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B91,B94,B97,B98,C12,C14,C15,C18,C19,C2,C21,C23,C25,C26,C28,C3,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C39,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C52,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C72,C73,C74,C78,C83,C9,D1,D2,D3,D6,D8 |
Chr5:10525390 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B109,B39,C20 |
Chr5:10525399 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B114,B127,B135,B45,B50,B93,C35,C76,D3 |
Chr5:10525415 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B25,B32,B4,C69 |
Chr5:10525432 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr5:10525436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr5:10525439 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B35,C8 |
Chr5:10525442 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 25 | A14,A9,B1,B108,B123,B124,B133,B137,B2,B25,B3,B59,B71,B76,B81,C1,C17,C34,C53,C59,C61,C63,C64,C66,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。