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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001318`

染色体: Chr05 坐标: 11337989-11338438 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001318`
名称	SmilChr05G001318
描述	uncharacterized SmilChr05G001318
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	11337989 - 11338438 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025511`
GeneID	`131025511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025511`
原始查询	`LOC131025511`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07470` (AT3G07470) transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935] identity=51.3; qcov=0.772; evalue=4.41e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0913100` - identity=45.7; qcov=0.779; evalue=3.12e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811288.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057811288.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811288.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811288.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:11337993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B84,B99,C75,C87
`Chr5:11338004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C53
`Chr5:11338005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B72,B86,C62
`Chr5:11338028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C72,D10
`Chr5:11338051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr5:11338059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B61,B79,B8
`Chr5:11338087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C6
`Chr5:11338119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B112
`Chr5:11338126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B112
`Chr5:11338127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B119,B92
`Chr5:11338134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr5:11338149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811288.1

149 aa

149

DUF538

PF04398 DUF538 17-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811288.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	17	125	2e-23	83.7	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955305.1
ATGGCGGAAGAAAATCCGCACCCCAAATCAGCGCAGCTGGTGATGTTTTACGACATCCTAAGCTCCCACGGCCTTCCCATCGGTATATTCCCCAAAAGCATCTTCGGTTTCTCCGTCGACCCCGCATCCGGCGGTTTCCGCCTCCGCTTGCCGTCTCCTTCGCCGTGCGACACCGTGTTCGAGACCCACCTCCGGTATGAATACGACATCACTGGACGTATCAACTACGGGAGGATTTCTAATTTGACGGACATTTTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025511
ATGGCGGAAGAAAATCCGCACCCCAAATCAGCGCAGCTGGTGATGTTTTACGACATCCTAAGCTCCCACGGCCTTCCCATCGGTATATTCCCCAAAAGCATCTTCGGTTTCTCCGTCGACCCCGCATCCGGCGGTTTCCGCCTCCGCTTGCCGTCTCCTTCGCCGTGCGACACCGTGTTCGAGACCCACCTCCGGTATGAATACGACATCACTGGACGTATCAACTACGGGAGGATTTCTAATTTGACGGACATTTTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811288.1
MAEENPHPKSAQLVMFYDILSSHGLPIGIFPKSIFGFSVDPASGGFRLRLPSPSPCDTVFETHLRYEYDITGRINYGRISNLTDILAQDLFLWLPTKGIQVDILSSELIYFDVEVVSKQFSLSLFDTLKNCSSAEDVDGYGDLLKIPQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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