当前解析结果
SmilChr05G001352| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001352 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001352 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G001352 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 12024797 - 12025939 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025520 |
|---|---|
| GeneID | 131025520 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025520 |
| 原始查询 | LOC131025520 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025520 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811296.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057811296.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811296.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811296.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811296.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:12024799 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B53,B59,C20 |
Chr5:12024799 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B53,B59,C20 |
Chr5:12024820 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A18,A22,B105,B113,B118,B139,B16,B69,B73,C25,C30,C43,C60,D11 |
Chr5:12024871 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | B10,B104,B134,B53,B59,B7,B99,C20,C24,C38,C77,C78,C79,C85 |
Chr5:12024913 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B120 |
Chr5:12024929 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A22,B105,B113,B118,B139,B16,B69,B73,C25,C30,C43,C60,D11 |
Chr5:12024988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C18,C28,C29 |
Chr5:12025018 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B16,B69,C30,D11 |
Chr5:12025068 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr5:12025293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr5:12025312 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A23,B10,B29,B67,B93,C13,C51 |
Chr5:12025501 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。