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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001413`

染色体: Chr05 坐标: 12753549-12754367 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001413`
名称	SmilChr05G001413
描述	uncharacterized SmilChr05G001413
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	12753549 - 12754367 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025529`
GeneID	`131025529`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025529`
原始查询	`LOC131025529`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0513700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0513700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G79740` (AT1G79740) hAT transposon superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844313] identity=24.5; qcov=0.857; evalue=6.18e-16; confidence=weak
Rice	`Os02g0513700` - identity=43.2; qcov=0.926; evalue=2.52e-67; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025529

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811306.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811306.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811306.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811306.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811306.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:12753568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:12753728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:12753760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:12753823`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B22,B99
`Chr5:12753823`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B22,B99
`Chr5:12753832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:12753938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:12753968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr5:12753975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B97
`Chr5:12754037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B134,B15,B80
`Chr5:12754177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C47
`Chr5:12754180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B4,B44,B53,B57,B58,B66,B72,B77,B83,B84,C16,C27,C61,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811306.1

272 aa

136

272

DUF659

PF04937 DUF659 183-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811306.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	183	267	3.6e-23	82.5	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955323.1
ATGGCAGCCGAAGAAAACAGAAATGCTGCTGTTCGTCCAACCAGCGGCGTCGACGACAAACCATTGTGGAGTCACGTTACTGTCCTAAGTGTTGCCGCAGGAGGAGGAGGAAATCGAACATGGACTTGCAACTACTGCAGCAAGAAAGTTGTTGGGTCTTATTCAAAGGTGAAAGCCCACCTTTTAAAGCTTCCAAATCATGGTGTAGCACCATGCAAATCAGTTTCAAGGGATATGCTTCAACAAATCAAAGAAGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025529
ATGGCAGCCGAAGAAAACAGAAATGCTGCTGTTCGTCCAACCAGCGGCGTCGACGACAAACCATTGTGGAGTCACGTTACTGTCCTAAGTGTTGCCGCAGGAGGAGGAGGAAATCGAACATGGACTTGCAACTACTGCAGCAAGAAAGTTGTTGGGTCTTATTCAAAGGTGAAAGCCCACCTTTTAAAGCTTCCAAATCATGGTGTAGCACCATGCAAATCAGTTTCAAGGGATATGCTTCAACAAATCAAAGAAGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811306.1
MAAEENRNAAVRPTSGVDDKPLWSHVTVLSVAAGGGGNRTWTCNYCSKKVVGSYSKVKAHLLKLPNHGVAPCKSVSRDMLQQIKEEHDEVERKKSQEAYQDKQKADYLSLPDGSDLQQHKKRKGKEVGPLEKSFNISQREKTDKQCARMFFASGLPFNFAKSPFFIDYSRTLANSSLSGYTPPTYNRIRTTLLGQEKEHVYRKLHPIRDSWMKKGVSIVSDGWSDRQRRPLINLMAASAGGAMFLKSVDASGIIKDGEYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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