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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001573`

染色体: Chr05 坐标: 14402231-14403103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001573`
名称	SmilChr05G001573
描述	uncharacterized SmilChr05G001573
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14402231 - 14403103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025550`
GeneID	`131025550`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025550`
原始查询	`LOC131025550`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=29; qcov=0.5; evalue=1.33e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=29.6; qcov=0.652; evalue=5.52e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025550

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811328.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811328.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811328.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811328.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811328.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14402239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:14402268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D11
`Chr5:14402321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr5:14402336`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B11,C32,C69
`Chr5:14402336`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B11,C32,C69
`Chr5:14402339`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B11,C32,C69
`Chr5:14402339`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B11,C32,C69
`Chr5:14402356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:14402358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	64	A10,A13,A18,A23,A24,A3,A5,A9,B1,B105,B107,B113,B118,B12,B13,B132,B135,B136,B137,B139,B14,B23,B27,B28,B33,B38,B39,B5,B56,B57,B59,B61,B65,B66,B67,B68,B70,B74,B77,B84,B89,B91,B96,C14,C18,C2,C21,C32,C39,C4,C40,C45,C54,C55,C58,C61,C62,C68,C71,C74,C75,C80,C84,C85
`Chr5:14402372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B69,D8
`Chr5:14402372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,D8
`Chr5:14402384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B54,C46,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811328.1

290 aa

145

290

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 95-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811328.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	95	187	3.1e-16	60.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955345.1
ATGGAAGAGATGTCAGTTTTCTGGAGTGAGGTATGGGTCGGGAGAAGTCCACTCAAGGTTTTATTTCCTAGACTTTTTCAGTTGAGCTTTGATAAAAAAATCAGTGTGGAGGGAATGGGGAAGAGGGAGGGGGAAGGTTGGGAGTGGGATCTCAAATGGCGAAGGGAATTGCGTGAGAGGGAGAAGGTGATGGTGAATGACTTGATGTCTGTGATTGGTTGTATTTCTCCATGCTTTGATTACAGGGACAGCTGGAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025550
ATGGAAGAGATGTCAGTTTTCTGGAGTGAGGTATGGGTCGGGAGAAGTCCACTCAAGGTTTTATTTCCTAGACTTTTTCAGTTGAGCTTTGATAAAAAAATCAGTGTGGAGGGAATGGGGAAGAGGGAGGGGGAAGGTTGGGAGTGGGATCTCAAATGGCGAAGGGAATTGCGTGAGAGGGAGAAGGTGATGGTGAATGACTTGATGTCTGTGATTGGTTGTATTTCTCCATGCTTTGATTACAGGGACAGCTGGAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811328.1
MEEMSVFWSEVWVGRSPLKVLFPRLFQLSFDKKISVEGMGKREGEGWEWDLKWRRELREREKVMVNDLMSVIGCISPCFDYRDSWKWCGTADGVFSTKAAYAECAKAKGVQSGECAEEIAQIWSALAPHKARVTTWRVVCNRLPTCHNLIKRRVPIGEEEKGCNACMTREETTDHIFLHCPKTDLVWDQIQQWIKIETAKPKSIVDHFKSFIGVGKGKNTRKFLLALWIGTIWLLWKYRNDSRWENKHWGVLSLVNDIKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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