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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001583`

染色体: Chr05 坐标: 14535874-14536335 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001583`
名称	SmilChr05G001583
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	14535874 - 14536335 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025554`
GeneID	`131025554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025554`
原始查询	`LOC131025554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,3-arabinosyltransferase XAT3-like
产物	alpha-1%2C3-arabinosyltransferase XAT3-like
Arabidopsis	`AT3G18170` (AT3G18170) Glycosyltransferase family 61 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821344] identity=41.7; qcov=0.941; evalue=1.16e-29; confidence=medium
Rice	`Os02g0135500` (P0585B01.29-1) - identity=39.3; qcov=0.915; evalue=1.08e-26; confidence=medium
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057811332.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057811332.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811332.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811332.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:14535946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A16,A18,A22,A25,B1,B109,B11,B113,B119,B120,B124,B126,B134,B139,B15,B2,B22,B32,B36,B42,B43,B44,B52,B57,B6,B60,B61,B62,B65,B66,B75,B79,B8,B85,B90,B91,B92,B94,C12,C14,C21,C29,C30,C34,C36,C37,C39,C4,C40,C44,C45,C46,C47,C50,C55,C59,C67,C7,D4,D5,D6,D7
`Chr5:14535986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B69,B9
`Chr5:14536002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B55,B79,D6
`Chr5:14536011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:14536062`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A11,A20,A25,A8,B103,B117,B12,B13,B130,B14,B140,B18,B2,B23,B26,B31,B33,B37,B38,B39,B40,B47,B50,B56,B68,B71,B96,B97,B98,C12,C17,C18,C29,C3,C43,C48,C5,C51,C52,C6,C62,C70,C72,C75,C80,C82,C86,D2,D5
`Chr5:14536080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B37,B44,C76,D3
`Chr5:14536084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B112
`Chr5:14536145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:14536162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B79,D6
`Chr5:14536217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B129,B99,C87,D10
`Chr5:14536234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B112
`Chr5:14536280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955349.1
ATGATCAAGGATGTAGGGTTTCAGGTGATTGTGGTGAGAAGATATGATCGTCGCGATATGAAGAAATTATCACAGCTGGTAAACTCGTGCAGCGTGCTTCTCGGTGTCCACGGCGCCAGCCTCACCAACGGTGTTTTCTTGCCTATGGGTGCCGTCGTTATCCCAATAGAACCACTCGACTTGGAGTACTTTTTTAACGCTATATTCGGTGACAATGCGCTTGCAATGGGGATGCAATACTTGCGTTACAAGATTGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025554
ATGATCAAGGATGTAGGGTTTCAGGTGATTGTGGTGAGAAGATATGATCGTCGCGATATGAAGAAATTATCACAGCTGGTAAACTCGTGCAGCGTGCTTCTCGGTGTCCACGGCGCCAGCCTCACCAACGGTGTTTTCTTGCCTATGGGTGCCGTCGTTATCCCAATAGAACCACTCGACTTGGAGTACTTTTTTAACGCTATATTCGGTGACAATGCGCTTGCAATGGGGATGCAATACTTGCGTTACAAGATTGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811332.1
MIKDVGFQVIVVRRYDRRDMKKLSQLVNSCSVLLGVHGASLTNGVFLPMGAVVIPIEPLDLEYFFNAIFGDNALAMGMQYLRYKIEDNESSLLKVFGRNSSVITDTSSVYRHHGTMASRDVFFVQQNVKLNLARFRENVVKALSIETDSTTQI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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