当前解析结果
SmilChr05G001624| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001624 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001624 |
| 描述 | glycine-rich RNA-binding protein GRP2A-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 15143545 - 15143919 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025562 |
|---|---|
| GeneID | 131025562 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025562 |
| 原始查询 | LOC131025562 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich RNA-binding protein GRP2A-like |
| 产物 | glycine-rich RNA-binding protein GRP2A-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025562 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057811342.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057811342.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057811342.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057811342.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811342.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:15143549 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B133,B74,C24 |
Chr5:15143550 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,B38,B75 |
Chr5:15143556 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C10,C23,C55 |
Chr5:15143568 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr5:15143569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B133,B74,C24 |
Chr5:15143571 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,B32,C13 |
Chr5:15143574 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B91,C70,C71 |
Chr5:15143575 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr5:15143576 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B74,C24,C73,D4 |
Chr5:15143612 |
CTG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 29 | A13,A21,A25,A7,B101,B12,B125,B13,B132,B135,B24,B28,B50,B57,B66,B71,B98,C19,C21,C22,C27,C47,C49,C5,C61,C65,C68,C86,D9 |
Chr5:15143615 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B30,C62 |
Chr5:15143636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。