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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001786`

染色体: Chr05 坐标: 17577998-17594175 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001786`
名称	SmilChr05G001786
描述	uncharacterized SmilChr05G001786
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	17577998 - 17594175 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025589`
GeneID	`131025589`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025589`
原始查询	`LOC131025589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0255200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0255200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=45.7; qcov=0.336; evalue=6.79e-28; confidence=low
Rice	`Os07g0255200` - identity=40.7; qcov=0.361; evalue=1.29e-30; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025589

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811371.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811371.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811371.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811371.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:17578018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr5:17593724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,C35,C59,C60
`Chr5:17593740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A3,B103,B119,B135,B139,B140,B63,C38,C51
`Chr5:17593761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B114,C51
`Chr5:17593777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B114,C14,C51,C9
`Chr5:17593803`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A24,B12,B16,B31,B53,B7,C60,D7
`Chr5:17593813`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A21,B26,C78,D2,D6
`Chr5:17593813`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A21,B26,C78,D2,D6
`Chr5:17593821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr5:17593845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B114,C14,C51,C74
`Chr5:17593846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr5:17593847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B104,B114,C14,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811371.1

449 aa

224

449

Pif1_2B_dom

DUF1985

PF21530 Pif1_2B_dom 61-107 aa PF09331 DUF1985 230-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811371.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	61	107	1.4e-19	70.2	DNA helicase Pif1, 2B domain
`XP_057811371.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	230	360	1.3e-13	51.9	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955388.1
ATGAATAATGCATTTGATCCAGAAATATTTAAGAATAAAGCTATCTTGGCCCCCACCAATGAGATGGTTGATACAATCAATGATTACGTCATGTCTAGCAAGGAAAGGGTTTACCTAAGTTCAGACAGTATTTGCAAAGAAGATGGACAAGTGGACCTTGATAAACAGAAATTCTCGGTTGAATATCTCAACACAATCAAGTGTTCAGGATTACTGAGTCATGAAATTAAATTGAAAGAAGGATGCATAATAATGCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025589
ATGAATAATGCATTTGATCCAGAAATATTTAAGAATAAAGCTATCTTGGCCCCCACCAATGAGATGGTTGATACAATCAATGATTACGTCATGTCTAGCAAGGAAAGGGTTTACCTAAGTTCAGACAGTATTTGCAAAGAAGATGGACAAGTGGACCTTGATAAACAGAAATTCTCGGTTGAATATCTCAACACAATCAAGTGTTCAGGATTACTGAGTCATGAAATTAAATTGAAAGAAGGATGCATAATAATGCTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811371.1
MNNAFDPEIFKNKAILAPTNEMVDTINDYVMSSKERVYLSSDSICKEDGQVDLDKQKFSVEYLNTIKCSGLLSHEIKLKEGCIIMLLRNIDPSNELCNGTRLIVTQLGERVIEGKLISGKNAGKKFPIARMIMSPSDFAKFPIRFQRRQFPVPYSMREQINRVAVEISTYNNISYLSTVVSRLNEIGGFALENTFRHGCFGMMLDWQPGQKCNAALHHIVSRHLKITRDDEDDEICFYINGRNVEFTPRDFALVTGLSFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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