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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001791`

染色体: Chr05 坐标: 17628116-17630069 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001791`
名称	SmilChr05G001791
描述	uncharacterized SmilChr05G001791
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	17628116 - 17630069 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025590`
GeneID	`131025590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025590`
原始查询	`LOC131025590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=26.5; qcov=0.678; evalue=4.54e-12; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve); PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025590

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811372.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811372.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811372.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811372.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:17628159`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	77	A10,A13,A16,A22,A5,A7,B1,B102,B103,B104,B11,B110,B111,B115,B121,B123,B125,B126,B128,B135,B14,B17,B22,B26,B28,B31,B33,B36,B42,B47,B5,B51,B52,B54,B55,B59,B60,B61,B62,B63,B69,B73,B74,B77,B81,B84,B90,B91,B94,B95,B97,C1,C11,C13,C15,C18,C20,C24,C29,C40,C41,C53,C54,C57,C58,C60,C61,C62,C65,C67,C69,C7,C73,C82,C87,C9,D9
`Chr5:17628161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B8,C46,C64
`Chr5:17628162`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A10,A22,A5,A7,B1,B104,B11,B111,B115,B121,B123,B125,B126,B128,B14,B17,B22,B28,B33,B36,B42,B47,B52,B54,B55,B59,B60,B61,B69,B74,B77,B81,B90,B91,B94,B95,B97,C1,C13,C20,C24,C40,C41,C53,C57,C58,C60,C61,C62,C65,C67,C7,C73,C87,C9,D9
`Chr5:17628174`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A13,A15,A9,B106,B11,B110,B26,B27,B33,B55,B59,B73,B77,B97,B98,C11,C13,C18,C54,C57,C62,C67,C69,C74,C82,D8
`Chr5:17628199`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A22,B11,B135,B31,B36,B55,B59,B60,B77,B95,B97,C20,C40,C54,C61,C82
`Chr5:17628239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C56,C58,C82
`Chr5:17628240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:17628246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B126
`Chr5:17628249`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C18
`Chr5:17628249`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C18
`Chr5:17628250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A5,B115,B95,C24,C58,C60,C73
`Chr5:17628267`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A24,A7,B100,B12,B122,B18,B2,B23,B54,B64,B89,B90,B94,B97,C63,C79,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811372.1

423 aa

212

423

rve

DUF8803

PF00665 rve 8-105 aa PF31073 DUF8803 229-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811372.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	8	105	2.9e-19	69.9	Integrase core domain
`XP_057811372.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	229	289	1.4e-23	83.2	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955389.1
ATGGGCGTCATGTATACTGCAGGCCCCTTTGACAAGTGGGGCATAGATATCGTTGGGAAGTTGCCCACGACACCAGGGGGCAAGTGTTTCCTCATAGTGGCAGTGGATTATTTCTCCAAATGGGTCGAGGCCGAGGCCGTGGGGAAGATCGACGAGGTGACAGTGGAGCGATTCATTTGGCGGAACATATGTTGCAGATTTGGCGTCCCAAGGATCATTGTGTCGGACAATGGAACCCAGTTTACAGGGCAGAGAATTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025590
ATGGGCGTCATGTATACTGCAGGCCCCTTTGACAAGTGGGGCATAGATATCGTTGGGAAGTTGCCCACGACACCAGGGGGCAAGTGTTTCCTCATAGTGGCAGTGGATTATTTCTCCAAATGGGTCGAGGCCGAGGCCGTGGGGAAGATCGACGAGGTGACAGTGGAGCGATTCATTTGGCGGAACATATGTTGCAGATTTGGCGTCCCAAGGATCATTGTGTCGGACAATGGAACCCAGTTTACAGGGCAGAGAATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811372.1
MGVMYTAGPFDKWGIDIVGKLPTTPGGKCFLIVAVDYFSKWVEAEAVGKIDEVTVERFIWRNICCRFGVPRIIVSDNGTQFTGQRIADFCDRMDITQRFVSVAHPQANGQVELANRSICEGIKKRLNQIRGKWVEELDTVLWAYRTSPNTATREASFTLVYGSNAVIPAEARLESYRITTYDTEHNSELQRTELDLVEEQREEAQIIAAKYKSIIKAGYDKRVIARKLAKGDLVLKRADALKPVGKFEPNWEGPFIITEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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