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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001831`

染色体: Chr05 坐标: 18360529-18361530 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001831`
名称	SmilChr05G001831
描述	uncharacterized SmilChr05G001831
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18360529 - 18361530 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025598`
GeneID	`131025598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025598`
原始查询	`LOC131025598`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=45.5; qcov=0.375; evalue=2.68e-31; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=58.8; qcov=0.924; evalue=9.25e-130; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811380.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057811380.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057811380.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811380.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18360568`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B108,B131,B50,B68,C2,D1
`Chr5:18360570`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	141	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A3,A6,A7,A8,B1,B10,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B118,B129,B13,B131,B134,B136,B137,B138,B139,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B26,B27,B28,B30,B35,B36,B38,B39,B41,B45,B5,B50,B51,B52,B54,B56,B58,B59,B60,B62,B64,B65,B68,B69,B7,B75,B78,B79,B8,B80,B82,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B91,B93,B94,B96,B97,B99,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C22,C23,C25,C28,C29,C30,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C50,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C65,C7,C70,C71,C72,C75,C77,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C86,D11,D2,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr5:18360607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B95,C61,C71
`Chr5:18360623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C21,C51,C80
`Chr5:18360632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:18360661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B121,B31,C5
`Chr5:18360666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,B73,B94,C26,C81
`Chr5:18360672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:18360750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:18360777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B137,B28,B54,B62,B89,C14,C39,C40,C45,C47,C70
`Chr5:18360791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B59
`Chr5:18360794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811380.1

328 aa

164

328

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 83-286 aa PF13359 DDE_Tnp_4 147-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811380.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	83	286	2e-93	312.4	Plant transposon protein
`XP_057811380.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	147	277	4.3e-08	33.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955397.1
CGTCGTCGATTTCGAATGAGAAGGGAGTTATTCCTTCGCATTGTTCATGCGTTGGAAAACCACTCAGATGAATTCAAATTGAGGCGAGATGCAACTGGAAGAACCGGCTTATCACCACTCCAAAAGTGCACGACAGCTATCCGTCAATTGGCATATGGGTGTCCAGGTGATTCACTCGATGAATATATACGAATGGGCGACAGAACTGTCTCGAGTTGTCTAGCCAATTTTTGTAAGTGTGTCATTGAGGTATTTGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025598
ATGAGAAGGGAGTTATTCCTTCGCATTGTTCATGCGTTGGAAAACCACTCAGATGAATTCAAATTGAGGCGAGATGCAACTGGAAGAACCGGCTTATCACCACTCCAAAAGTGCACGACAGCTATCCGTCAATTGGCATATGGGTGTCCAGGTGATTCACTCGATGAATATATACGAATGGGCGACAGAACTGTCTCGAGTTGTCTAGCCAATTTTTGTAAGTGTGTCATTGAGGTATTTGGAGCTCAATACTTGAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811380.1
MRRELFLRIVHALENHSDEFKLRRDATGRTGLSPLQKCTTAIRQLAYGCPGDSLDEYIRMGDRTVSSCLANFCKCVIEVFGAQYLRSPNQDDIQRLLQLHEQRHGFPGMLGSLDYMHWEWKNCPVAWKGQYTRGDYGVPIVIFEAVASADLWIWHAFFGQARSNNDINVLHGSSLFNAVLQGNSPQVQFTVNGTSYNFGYYLTDGIYPEWASFVKSFPCPMDPKRVKFKERQEAARNDVERAFGVLQSRWTIIRNPARSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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