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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001861`

染色体: Chr05 坐标: 18647327-18649000 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001861`
名称	SmilChr05G001861
描述	uncharacterized SmilChr05G001861
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18647327 - 18649000 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025603`
GeneID	`131025603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025603`
原始查询	`LOC131025603`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=32.1; qcov=0.448; evalue=1.41e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=27.9; qcov=0.873; evalue=2.68e-37; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811386.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811386.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811386.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811386.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811386.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18647335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,D3
`Chr5:18647342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B17,B41
`Chr5:18647344`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A1,A13,A18,A6,B1,B112,B114,B129,B18,B25,B28,B44,B46,B47,B5,B53,B54,B59,B60,B62,B68,B74,B79,B82,B89,B9,C12,C13,C14,C26,C31,C39,C40,C45,C47,C48,C54,C56,C57,C67,C70,C73,C77,C78,C85,C9
`Chr5:18647374`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B18,C85
`Chr5:18647374`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B18,C85
`Chr5:18647380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C21,C24,C73,D11,D3
`Chr5:18647455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C60,C71
`Chr5:18647482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,C11,C60,C69
`Chr5:18647486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C28,C34
`Chr5:18647521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B134,B37
`Chr5:18647536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B22,B56,B96,C74
`Chr5:18647706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811386.1

480 aa

240

480

RVT_1

PF00078 RVT_1 72-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811386.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	72	256	1.8e-16	61.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955403.1
ATGGACAAGAACAGCGCACCCGGTCCCAACGGCTTTAATGGCACTTTTTTTCAGCATGCTTGGGAGATTATTGCTTCGGATGTGGTTGGCGCGGTCCAACGTTTCTTCTCTCATGGTTATCTTCCTAACGGTCTCAATGCTAATTTTCGGTGCCTGCTCCCTAAGAAGCCGAACGTCGAGCTTATTTCTGACTACAGGCCAATCGTGCTCAGGAAGAACATTGCTCTTAAAGTTGACATTAAAAAAGCCTTTGACACTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025603
ATGGACAAGAACAGCGCACCCGGTCCCAACGGCTTTAATGGCACTTTTTTTCAGCATGCTTGGGAGATTATTGCTTCGGATGTGGTTGGCGCGGTCCAACGTTTCTTCTCTCATGGTTATCTTCCTAACGGTCTCAATGCTAATTTTCGGTGCCTGCTCCCTAAGAAGCCGAACGTCGAGCTTATTTCTGACTACAGGCCAATCGTGCTCAGGAAGAACATTGCTCTTAAAGTTGACATTAAAAAAGCCTTTGACACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811386.1
MDKNSAPGPNGFNGTFFQHAWEIIASDVVGAVQRFFSHGYLPNGLNANFRCLLPKKPNVELISDYRPIVLRKNIALKVDIKKAFDTLDWNFIDTVLKAFGFPIIFYNWIQAIFGSAHISIMLNGALHGYFSCSRGVCLGDHLSPILFGIAEDVLSRLFQAADSAKYISCMRMSRSEFFHSHLLYADDVLLFCQATRRNCIMVDSILNIYAQASGQMCNKEKFTLYFGKGVSMARKHRLQCLLGFRPGSIPFIYLGVLIFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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