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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001868`

染色体: Chr05 坐标: 18828257-18829547 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001868`
名称	SmilChr05G001868
描述	uncharacterized SmilChr05G001868
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	18828257 - 18829547 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025605`
GeneID	`131025605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025605`
原始查询	`LOC131025605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsSCL3; symbol=OsSCL3; hit=Os06g0216700; species=rice; confidence=low
产物	OsSCL3; symbol=OsSCL3; hit=Os06g0216700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G15780` (AT2G15780) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816073] identity=44.2; qcov=0.748; evalue=8.71e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0216700` (OsSCL3) - identity=41.1; qcov=0.874; evalue=3.31e-19; confidence=low
GO	GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057811388.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057811388.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057811388.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811388.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:18828299`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A4,B17,B32,B41,B8
`Chr5:18828299`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A4,B17,B32,B41,B8
`Chr5:18828374`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	127	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A2,A21,A22,A24,A4,A6,A7,A8,A9,B102,B103,B106,B108,B110,B113,B114,B117,B119,B12,B122,B123,B129,B131,B132,B133,B135,B137,B139,B18,B20,B21,B23,B25,B26,B30,B31,B33,B36,B38,B39,B4,B41,B45,B47,B49,B50,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B6,B63,B64,B66,B68,B71,B73,B75,B76,B77,B78,B81,B82,B85,B86,B87,B90,B91,B93,B96,C1,C11,C17,C18,C19,C20,C23,C27,C29,C30,C31,C35,C36,C37,C40,C41,C42,C43,C46,C47,C48,C50,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C73,C75,C78,C81,C82,D10,D11,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr5:18829406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:18829407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:18829452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955405.1
ATGGCCTCAAATTCTGCATTAGCTGCAGTTCTCTTTCTAACTTCATTCATGTTTGGTTGTGGCTTAGCTGCCACCGTCGTTGTCGGAGGCTCTGCGGGGTGGCGCTTCGGCTACAACTACACCGATTGGGCTCTCAAACACGGTCCCTTCTACATCAATGATACTCTAGTGTTCAAGTATGTGGCGACGACTACGAGCAACGGGAGCGAGTCACACAGCGTGTACTTGCTCCCAAATCTATACAGCTACGTGCAGTGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025605
ATGGCCTCAAATTCTGCATTAGCTGCAGTTCTCTTTCTAACTTCATTCATGTTTGGTTGTGGCTTAGCTGCCACCGTCGTTGTCGGAGGCTCTGCGGGGTGGCGCTTCGGCTACAACTACACCGATTGGGCTCTCAAACACGGTCCCTTCTACATCAATGATACTCTAGTGTTCAAGTATGTGGCGACGACTACGAGCAACGGGAGCGAGTCACACAGCGTGTACTTGCTCCCAAATCTATACAGCTACGTGCAGTGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811388.1
MASNSALAAVLFLTSFMFGCGLAATVVVGGSAGWRFGYNYTDWALKHGPFYINDTLVFKYVATTTSNGSESHSVYLLPNLYSYVQCDCSRAQLLSNPSGSGGC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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