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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002458`

染色体: Chr01 坐标: 42202634-42205023 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002458`
名称	SmilChr01G002458
描述	MYB-like transcription factor ODO1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42202634 - 42205023 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025610`
GeneID	`131025610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025610`
原始查询	`LOC131025610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MYB-like transcription factor ODO1
产物	MYB-like transcription factor ODO1
Arabidopsis	`AT4G22680` (MYB85) myb domain protein 85 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828364] identity=58.6; qcov=1.06; evalue=1.68e-98; confidence=high
Rice	`Os09g0532900` (OsMYB42/85) - identity=58; qcov=1.06; evalue=2.52e-94; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811395.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811395.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811395.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811395.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42204231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C38
`Chr1:42204238`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr1:42204238`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr1:42204287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:42204309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:42204615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B10,B100,B107,B12,C5
`Chr1:42204615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B100,B107,B12,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811395.1

252 aa

126

252

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-76 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 72-115 aa PF00249 Myb_DNA-binding 73-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811395.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	3.9e-33	114.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057811395.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	76	2.1e-18	66.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057811395.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	72	115	2.1e-18	66.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057811395.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	73	111	3.9e-33	114.0	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955412.1
GCTGATGTTATGGTTGAGTAAGATTGCATTCACAGAATACCACTTTGTAGCAAAACATTAAAAGAAATTAATCATTTAACTTTTTCATTTTCTTTTGTGTGGGGGGTGGCAGGGGTGGGGGTGCTGTGGCTTTGTCTTGGGGTCACCCCCATCATTCACTATCTGGAGTCGATACCACCAGAACAGGCTTTTGTAGTTCATCAGTTCCTTTCAAAAAACCAATGGTGGGCCCTCCAAACACACACACACACACAACACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025610
ATGGGGCGACAACCGTGTTGCGACAAGCTCGGGGTGAAGAAGGGGCCGTGGACGGCGGAGGAAGACAAGAAGCTCATCAACTTTATCCTCACCAACGGCCAATGCTGCTGGCGGGCCGTCCCCAAACTGGCGGGCCTCCGCCGCTGTGGGAAGAGCTGCCGTCTCCGCTGGACCAACTACCTCCGCCCCGACTTGAAGCGGGGCCTCCTCAACGACGCCGAGGAGCAGTTGGTCATTGATCTTCATGCACGCCTTGGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811395.1
MGRQPCCDKLGVKKGPWTAEEDKKLINFILTNGQCCWRAVPKLAGLRRCGKSCRLRWTNYLRPDLKRGLLNDAEEQLVIDLHARLGNRWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLLKMGIDPVTHEPLNKDQTEEKQQTPPPPDVPFAGEETSCSPTDQNSSSDESNSNMYENDPLISCLFRDDPPQMDFPWEFPSAQEGVAASAWDHSCQWLLDCQDFGVHDFGFECFNDVGVVGNNLELGLIETGNNNQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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