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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001888`

染色体: Chr05 坐标: 19188247-19189155 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001888`
名称	SmilChr05G001888
描述	uncharacterized protein At4g02000-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19188247 - 19189155 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025612`
GeneID	`131025612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025612`
原始查询	`LOC131025612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleic acid binding / zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816302]; symbol=AT2G17920; hit=AT2G17920; species=arabidopsis; confidence=low
产物	nucleic acid binding / zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816302]; symbol=AT2G17920; hit=AT2G17920; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G17920` (AT2G17920) nucleic acid binding / zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816302] identity=31.6; qcov=0.523; evalue=3.43e-17; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=30.4; qcov=0.523; evalue=1.86e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811394.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811394.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811394.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811394.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811394.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19188259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C24
`Chr5:19188268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B104,B105,B37,B42,B43,C60,C65,D5
`Chr5:19188269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	D10,D11
`Chr5:19188269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr5:19188277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B63,C75
`Chr5:19188278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B16,B64
`Chr5:19188290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr5:19188314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C11,C45,C69,D10,D11
`Chr5:19188317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr5:19188322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr5:19188326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B111,C2,C84,D1
`Chr5:19188332`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B59,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811394.1

302 aa

151

302

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 107-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811394.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	107	152	1.1e-14	54.5	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955411.1
ATGAAGGATATCAGACAAGGAAGATTCATCTTTCAATTCTTCCACGAGCTTGATCTACTACGGGTTTTTGAAGGAGGCCCTTGGGCTTTTGGCAACTTTTCCCTCATTCTTCATAGGCTCAAGAGGGGGGAGTTTCCGTTGAATGTGCCACTGGATTTCCTACCCTTCTGGGTTCAGATTCACGATCTCCCCGCTGGTTATCTCACCGAGGGGGTGGGCCGGCTTCTGGCTAATTTCATTGGTACGTTTTTGGAATATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025612
ATGAAGGATATCAGACAAGGAAGATTCATCTTTCAATTCTTCCACGAGCTTGATCTACTACGGGTTTTTGAAGGAGGCCCTTGGGCTTTTGGCAACTTTTCCCTCATTCTTCATAGGCTCAAGAGGGGGGAGTTTCCGTTGAATGTGCCACTGGATTTCCTACCCTTCTGGGTTCAGATTCACGATCTCCCCGCTGGTTATCTCACCGAGGGGGTGGGCCGGCTTCTGGCTAATTTCATTGGTACGTTTTTGGAATATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811394.1
MKDIRQGRFIFQFFHELDLLRVFEGGPWAFGNFSLILHRLKRGEFPLNVPLDFLPFWVQIHDLPAGYLTEGVGRLLANFIGTFLEYDSSNSTDVWRQYMRVHVDIRVADPLNRFKRIKQKDGSSFVVNFKYERLNVLFFLCGRLSHSENFCELMFTPVAKDIEREWGVWLKAADRRMTNLARDKWLRSDNTETNLSMDASAARVSTEPPTSATKRKSQENRSVSLPINAAIIPRDPIPQTTPRLALQDITHEICASDLMM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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