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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001923`

染色体: Chr05 坐标: 19491506-19491946 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001923`
名称	SmilChr05G001923
描述	uncharacterized SmilChr05G001923
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19491506 - 19491946 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025618`
GeneID	`131025618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025618`
原始查询	`LOC131025618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817797]; symbol=AT2G32360; hit=AT2G32360; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ubiquitin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817797]; symbol=AT2G32360; hit=AT2G32360; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G32360` (AT2G32360) Ubiquitin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817797] identity=43; qcov=0.541; evalue=2.34e-13; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005654 (nucleoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0031593 (polyubiquitin modification-dependent protein binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0070628 (proteasome binding)
KEGG	-
Pfam	PF00240 (ubiquitin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811399.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811399.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811399.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811399.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19491589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr5:19491604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,C33,C6,C79
`Chr5:19491628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B27,B48,C2
`Chr5:19491637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,C22,C30,C50,D9
`Chr5:19491702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C4
`Chr5:19491818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B132,B66,B80,C60
`Chr5:19491866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B14,B27,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811399.1

146 aa

146

ubiquitin

PF00240 ubiquitin 27-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811399.1`	Pfam	`PF00240`	ubiquitin	Domain	27	91	4.9e-07	30.1	Ubiquitin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955416.1
ATGGAGTCCACGAAAATGGGACTGGTACAAGAAAAGTGGAAATCTGGTGTGTTGAAAATGAAGCTGGTGGCAGAGATACTCACCGGAAGTCTGTTCTACGTCGAGGTGGGAGCGGATGCCACCGTGGGCGACCTCAAGAAGGAGATCGGGAAACAGGAAAACCTACCCGGGGATCGCCTCATTCTGCTGCTTGATGCTGAGGAGCGTTACTCGTTGGATAAAGACGAAGCTTCTCTCAAGGATTACGGGGTTGAAGATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025618
ATGGAGTCCACGAAAATGGGACTGGTACAAGAAAAGTGGAAATCTGGTGTGTTGAAAATGAAGCTGGTGGCAGAGATACTCACCGGAAGTCTGTTCTACGTCGAGGTGGGAGCGGATGCCACCGTGGGCGACCTCAAGAAGGAGATCGGGAAACAGGAAAACCTACCCGGGGATCGCCTCATTCTGCTGCTTGATGCTGAGGAGCGTTACTCGTTGGATAAAGACGAAGCTTCTCTCAAGGATTACGGGGTTGAAGATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811399.1
MESTKMGLVQEKWKSGVLKMKLVAEILTGSLFYVEVGADATVGDLKKEIGKQENLPGDRLILLLDAEERYSLDKDEASLKDYGVEDSSHIYIFFQDNIAASSASPLTPKESTSVDNTDEADEDEAPRHENASVEANEPSASVDQEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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