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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001997`

染色体: Chr05 坐标: 20701700-20702473 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001997`
名称	SmilChr05G001997
描述	uncharacterized SmilChr05G001997
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20701700 - 20702473 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025635`
GeneID	`131025635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025635`
原始查询	`LOC131025635`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=34.3; qcov=0.411; evalue=3.27e-08; confidence=low
Rice	`Os01g0646700` - identity=39.5; qcov=0.994; evalue=2.13e-29; confidence=medium
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811415.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811415.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057811415.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811415.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20701714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B140,B98,C16,C42
`Chr5:20701716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C28
`Chr5:20701721`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B132,B22,B42,C63,C64
`Chr5:20701721`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B132,B22,B42,C63,C64
`Chr5:20701748`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C11
`Chr5:20701748`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C11
`Chr5:20701753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C42
`Chr5:20701761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B98,C45
`Chr5:20701839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C15,C81,D3
`Chr5:20701852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,D7
`Chr5:20701939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A5,B135,B8,C58
`Chr5:20702238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B69,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811415.1

163 aa

163

PIF1

PF05970 PIF1 1-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811415.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	1	108	4.8e-43	148.1	PIF1-like helicase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955432.1
ATGACACATAGATACTGTTTTGAAGCGCTTGATAGAAGCTTAAGGGATATTATGAGATCTTCCGATAGGTCTGGAAAACCTTTTGGAGGTTTGGTGGTTGTTTTAGGAGGCGACTTTCGACAGATACTTCCAGTGATCCCTAAGGGAAGTCGGCATGACATCGTGCATGCCTCTATAAGTTCATCTCAACTTTGGAATTCGTGTCAAGTTTTCAAGTTAACTAAGAACATGAGATTACAGGCAAATGCTTCTGCTTCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025635
ATGACACATAGATACTGTTTTGAAGCGCTTGATAGAAGCTTAAGGGATATTATGAGATCTTCCGATAGGTCTGGAAAACCTTTTGGAGGTTTGGTGGTTGTTTTAGGAGGCGACTTTCGACAGATACTTCCAGTGATCCCTAAGGGAAGTCGGCATGACATCGTGCATGCCTCTATAAGTTCATCTCAACTTTGGAATTCGTGTCAAGTTTTCAAGTTAACTAAGAACATGAGATTACAGGCAAATGCTTCTGCTTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811415.1
MTHRYCFEALDRSLRDIMRSSDRSGKPFGGLVVVLGGDFRQILPVIPKGSRHDIVHASISSSQLWNSCQVFKLTKNMRLQANASASDAEETKEFAEWILKIGDGTAEHNLGDGESVVALSEDILIRDATNPIAAIVENTYNDVMNNAFDPEMFKNRAILAPHQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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